46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4130 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  100 
 
 
539 aa  1124    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  25.31 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  25.74 
 
 
482 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  25.16 
 
 
474 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  23.64 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  24.61 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  25.41 
 
 
476 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  22.51 
 
 
508 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  24.12 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  22.34 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  22.74 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  25.95 
 
 
479 aa  68.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  24.8 
 
 
504 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  25.27 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  21.44 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  23.28 
 
 
474 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  23.03 
 
 
500 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  23.75 
 
 
510 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  23.47 
 
 
492 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  25.31 
 
 
499 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  23.17 
 
 
506 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  24.02 
 
 
504 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  23.03 
 
 
489 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  24.02 
 
 
532 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  23.81 
 
 
482 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  20.26 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  22.51 
 
 
480 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.35 
 
 
492 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  25.35 
 
 
484 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  22.49 
 
 
500 aa  53.9  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  23.42 
 
 
510 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  23.87 
 
 
505 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.66 
 
 
536 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  23.84 
 
 
525 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  22.54 
 
 
486 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  24.52 
 
 
529 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  21.85 
 
 
515 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  22.8 
 
 
481 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  23.46 
 
 
543 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  24.63 
 
 
518 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  30.34 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  23.93 
 
 
522 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  23.75 
 
 
520 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  20.04 
 
 
547 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  22.08 
 
 
546 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  22.44 
 
 
515 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>