84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1168 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  70.19 
 
 
482 aa  680    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  976    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  37.07 
 
 
515 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  33.81 
 
 
476 aa  250  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  36.44 
 
 
474 aa  249  9e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  35.62 
 
 
504 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  34.17 
 
 
515 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  37.98 
 
 
511 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  36.32 
 
 
514 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  33.71 
 
 
510 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  35.1 
 
 
525 aa  224  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  33.13 
 
 
488 aa  223  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  34.05 
 
 
540 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  33.27 
 
 
492 aa  213  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  36.52 
 
 
513 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  32.78 
 
 
486 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  31.63 
 
 
508 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  33.07 
 
 
480 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  35.8 
 
 
509 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  32.12 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  32.45 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  33.84 
 
 
506 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  32.5 
 
 
508 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  32.39 
 
 
479 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  31.02 
 
 
505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  33.93 
 
 
488 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  34.41 
 
 
483 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  36.25 
 
 
528 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  30.77 
 
 
498 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  30.89 
 
 
482 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  32.31 
 
 
524 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  31.91 
 
 
487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  31.3 
 
 
510 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  30.62 
 
 
479 aa  179  9e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  31.3 
 
 
504 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  30.35 
 
 
500 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  32.51 
 
 
522 aa  173  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  30.43 
 
 
489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  31.76 
 
 
489 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  31.54 
 
 
529 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  33.67 
 
 
526 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  31.34 
 
 
514 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  33.05 
 
 
517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  27.9 
 
 
536 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  29.95 
 
 
518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  30.98 
 
 
543 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  30.9 
 
 
526 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  30.35 
 
 
463 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  30.84 
 
 
533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  26.97 
 
 
532 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  29.91 
 
 
541 aa  140  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  25.88 
 
 
547 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  31.77 
 
 
528 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  29.21 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  30.73 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  29.71 
 
 
525 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  30.77 
 
 
538 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  25.49 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  26.57 
 
 
531 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  28.81 
 
 
532 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  27.32 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  27 
 
 
530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  27.58 
 
 
446 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  30.33 
 
 
487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  28.78 
 
 
525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  29.34 
 
 
484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  27.51 
 
 
534 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  28.46 
 
 
472 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25.67 
 
 
534 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  25.91 
 
 
533 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  26.57 
 
 
552 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  24.21 
 
 
492 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  25.96 
 
 
541 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  27.81 
 
 
474 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  25.35 
 
 
478 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  28.57 
 
 
578 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  27.06 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  31.25 
 
 
570 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  26.54 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  36.22 
 
 
630 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  25 
 
 
476 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  25.93 
 
 
476 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  24.41 
 
 
481 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  22.65 
 
 
539 aa  53.9  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>