86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1097 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  70.75 
 
 
504 aa  701    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  100 
 
 
508 aa  1040    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  35.52 
 
 
479 aa  264  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  36.24 
 
 
483 aa  264  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  35.81 
 
 
492 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  34.49 
 
 
476 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  35.82 
 
 
489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  34.57 
 
 
474 aa  251  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  33.03 
 
 
547 aa  226  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  34.87 
 
 
546 aa  220  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  32.88 
 
 
481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  28.41 
 
 
500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  31.18 
 
 
487 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  29.57 
 
 
522 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  32.32 
 
 
482 aa  190  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  30.17 
 
 
504 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  30.98 
 
 
525 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  30 
 
 
498 aa  183  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  30.17 
 
 
514 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  29.03 
 
 
531 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  30.94 
 
 
510 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  31.25 
 
 
538 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  29.58 
 
 
488 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  29.38 
 
 
488 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  29.21 
 
 
518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  32.71 
 
 
505 aa  173  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  30.41 
 
 
513 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  28.35 
 
 
486 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  29.08 
 
 
506 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  28.41 
 
 
510 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  29.34 
 
 
498 aa  166  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  28.57 
 
 
480 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  29.31 
 
 
508 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  29.12 
 
 
482 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  27.7 
 
 
511 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  27.85 
 
 
509 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  29.74 
 
 
529 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  28 
 
 
479 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  28.11 
 
 
528 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  28.6 
 
 
524 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  27.53 
 
 
528 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  28.47 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  29.28 
 
 
533 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  29.24 
 
 
526 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  29.94 
 
 
487 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  28.49 
 
 
500 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  29.89 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  26.06 
 
 
540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  28.44 
 
 
489 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  28.42 
 
 
515 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  27.03 
 
 
515 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  30.39 
 
 
525 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  26.19 
 
 
536 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  27.61 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.5 
 
 
533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  31.79 
 
 
570 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  28.6 
 
 
463 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.87 
 
 
499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  25.77 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  28.02 
 
 
526 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  27.29 
 
 
532 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  25.17 
 
 
552 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  24.72 
 
 
517 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  25.18 
 
 
525 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  28.64 
 
 
534 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25 
 
 
532 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  24.49 
 
 
530 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.35 
 
 
492 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  26.75 
 
 
472 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  25 
 
 
541 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  23.94 
 
 
532 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  26.39 
 
 
484 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  27.16 
 
 
534 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  26.89 
 
 
536 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.39 
 
 
473 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  22.51 
 
 
539 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  23.92 
 
 
578 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  23.67 
 
 
478 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  23.82 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  27.27 
 
 
481 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  24.65 
 
 
476 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  23.12 
 
 
474 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  22.78 
 
 
476 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 
596 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 
502 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  30.63 
 
 
630 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>