83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3979 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1060    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  58.08 
 
 
525 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  51.74 
 
 
528 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  49.52 
 
 
514 aa  465  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  44.81 
 
 
526 aa  363  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  36.8 
 
 
532 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  41.24 
 
 
541 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  35.99 
 
 
543 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  37.27 
 
 
526 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  36.88 
 
 
530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  32.33 
 
 
552 aa  216  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  31.4 
 
 
525 aa  200  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  31.2 
 
 
504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  31.2 
 
 
513 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  31.51 
 
 
540 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  29.36 
 
 
524 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  29.82 
 
 
520 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  29.56 
 
 
510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  30.7 
 
 
511 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  29.56 
 
 
505 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  28.27 
 
 
509 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  29.94 
 
 
476 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  30.36 
 
 
474 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  31.55 
 
 
482 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  29.45 
 
 
525 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  28.88 
 
 
483 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  28.84 
 
 
514 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  28.87 
 
 
486 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  29.47 
 
 
482 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  28.54 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  33.05 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  29.29 
 
 
528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  27.97 
 
 
508 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  28.43 
 
 
488 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  28.76 
 
 
498 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  27.71 
 
 
479 aa  139  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  28.04 
 
 
515 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  27.52 
 
 
529 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  26.67 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  31.74 
 
 
488 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  28.62 
 
 
510 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  29.8 
 
 
522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  27.97 
 
 
480 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  29.71 
 
 
515 aa  126  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  27.66 
 
 
506 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  27.61 
 
 
533 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  29.11 
 
 
533 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.7 
 
 
489 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  28.98 
 
 
536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  26.28 
 
 
479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  26.63 
 
 
487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  25.65 
 
 
489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  27.24 
 
 
500 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  24.72 
 
 
508 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  25.3 
 
 
463 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  28.41 
 
 
541 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  27.09 
 
 
570 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  33.69 
 
 
630 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  23.48 
 
 
536 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  27.94 
 
 
547 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.7 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  25.6 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  24.07 
 
 
531 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  26.12 
 
 
534 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  25.18 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  24.56 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  27.21 
 
 
518 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  26.19 
 
 
532 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  26.02 
 
 
538 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  27.31 
 
 
504 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.71 
 
 
532 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  28.4 
 
 
472 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  27.79 
 
 
534 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  24.81 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.33 
 
 
473 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  22.7 
 
 
484 aa  63.9  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  25.44 
 
 
478 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.46 
 
 
474 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  26.06 
 
 
476 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  24.36 
 
 
578 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  24.88 
 
 
446 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  26.56 
 
 
476 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  26.06 
 
 
481 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>