83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7042 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1100    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  55.39 
 
 
532 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  29.89 
 
 
489 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  27.59 
 
 
578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.68 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  28.18 
 
 
482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  27.91 
 
 
481 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.59 
 
 
546 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  27.27 
 
 
483 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  25.61 
 
 
463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  27.69 
 
 
474 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  25.97 
 
 
514 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  27.04 
 
 
511 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  25.18 
 
 
504 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  25 
 
 
547 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  27.42 
 
 
525 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  25.05 
 
 
476 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  27.54 
 
 
513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  24.33 
 
 
510 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  26.22 
 
 
508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  27.34 
 
 
522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  27.94 
 
 
528 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  25.09 
 
 
482 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  25.23 
 
 
492 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  27.69 
 
 
472 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  27.05 
 
 
500 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  24.73 
 
 
499 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  26.3 
 
 
498 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  24.6 
 
 
506 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  25.28 
 
 
481 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  25.14 
 
 
500 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  25.96 
 
 
509 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  25.52 
 
 
487 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  25.44 
 
 
570 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  24.15 
 
 
532 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  25.43 
 
 
514 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  23.81 
 
 
480 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.28 
 
 
478 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  25.95 
 
 
510 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  23.65 
 
 
505 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  24.82 
 
 
488 aa  94  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  23.92 
 
 
540 aa  93.6  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  26.67 
 
 
446 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  26.32 
 
 
479 aa  91.7  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  24.91 
 
 
473 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  22.39 
 
 
489 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  24.91 
 
 
479 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  24.78 
 
 
518 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  23.48 
 
 
517 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  25.3 
 
 
498 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  25.13 
 
 
520 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  25.89 
 
 
484 aa  84  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  23.97 
 
 
486 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  25.49 
 
 
504 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  26.55 
 
 
515 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  24 
 
 
531 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  25.56 
 
 
533 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  26.07 
 
 
492 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  29.11 
 
 
474 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  26.89 
 
 
508 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  27.04 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  23.69 
 
 
536 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  24.37 
 
 
525 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  23.81 
 
 
528 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  24.7 
 
 
533 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  24.34 
 
 
524 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  25.43 
 
 
543 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  25 
 
 
526 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  23.18 
 
 
541 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  27.06 
 
 
488 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  23.52 
 
 
529 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  22.75 
 
 
476 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  30.33 
 
 
552 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  31.71 
 
 
526 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  28.81 
 
 
538 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  23.11 
 
 
534 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  27.23 
 
 
630 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  22.87 
 
 
525 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  21.65 
 
 
532 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  29.03 
 
 
476 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  25.66 
 
 
539 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  30.71 
 
 
530 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  21.82 
 
 
541 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>