83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3488 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1086    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  47.69 
 
 
514 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  44.49 
 
 
525 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  44.81 
 
 
517 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  38.98 
 
 
528 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  37.17 
 
 
532 aa  315  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  38.85 
 
 
541 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  34.39 
 
 
543 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  34.07 
 
 
526 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  31.94 
 
 
530 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  30.89 
 
 
552 aa  203  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  33.55 
 
 
514 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  29.96 
 
 
508 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  30.62 
 
 
504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  29.41 
 
 
525 aa  183  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  29.77 
 
 
510 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  31.44 
 
 
511 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  30.39 
 
 
525 aa  181  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  28.73 
 
 
492 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  30.07 
 
 
509 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  29.73 
 
 
513 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  29.8 
 
 
488 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  30.44 
 
 
498 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  29.43 
 
 
505 aa  176  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  34.41 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  29.89 
 
 
540 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  28.52 
 
 
476 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  33.67 
 
 
481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  30.23 
 
 
515 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  29.53 
 
 
479 aa  163  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  29.9 
 
 
520 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  29.48 
 
 
486 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  26.06 
 
 
536 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  27.39 
 
 
524 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  29.42 
 
 
508 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  32.49 
 
 
482 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  32.39 
 
 
515 aa  154  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  32.85 
 
 
504 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  28.4 
 
 
522 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  26.76 
 
 
480 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  28.14 
 
 
529 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  26.97 
 
 
498 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  29.6 
 
 
528 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  29.95 
 
 
483 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.32 
 
 
489 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  27.99 
 
 
489 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.74 
 
 
533 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  28.82 
 
 
533 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  26.67 
 
 
488 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  28.15 
 
 
547 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  26.31 
 
 
500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  34.54 
 
 
487 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  28.04 
 
 
479 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  26.34 
 
 
546 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  30.05 
 
 
538 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  26.57 
 
 
510 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  28.54 
 
 
482 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  25.89 
 
 
506 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  29.79 
 
 
463 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  25.91 
 
 
487 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  25.49 
 
 
531 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  28.27 
 
 
518 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  25.18 
 
 
534 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  24.71 
 
 
541 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  28.33 
 
 
499 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  27.35 
 
 
532 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  28.5 
 
 
532 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  38.59 
 
 
570 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  26.76 
 
 
472 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.63 
 
 
478 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  24.58 
 
 
500 aa  88.6  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  24.68 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  26.15 
 
 
534 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  26.39 
 
 
484 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.52 
 
 
473 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  26.15 
 
 
630 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  23.1 
 
 
536 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  25.31 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.29 
 
 
474 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  22.1 
 
 
481 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  25.19 
 
 
578 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  27.49 
 
 
476 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  21.58 
 
 
539 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>