83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6465 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1056    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  50.39 
 
 		 525 aa  507  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  52.2 
 
 		 524 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  51.57 
 
 		 520 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  40.04 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  40.08 
 
 		 528 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  38.83 
 
 		 540 aa  316  6e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  38.01 
 
 		 510 aa  302  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  37.09 
 
 		 506 aa  302  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  35.21 
 
 		 510 aa  289  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  36.8 
 
 		 514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  35.49 
 
 		 513 aa  266  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  34.6 
 
 		 508 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  32.44 
 
 		 505 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  34 
 
 		 529 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  32.55 
 
 		 533 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  33.08 
 
 		 498 aa  229  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  37.98 
 
 		 481 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  32.44 
 
 		 509 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  32 
 
 		 476 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  33.07 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  33.85 
 
 		 482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  31.63 
 
 		 498 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  31.12 
 
 		 483 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  29.12 
 
 		 486 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  28.7 
 
 		 522 aa  176  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  28.99 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  31.25 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  29.42 
 
 		 500 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  29.73 
 
 		 515 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  30.7 
 
 		 517 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  27.08 
 
 		 528 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  29.68 
 
 		 482 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  31.48 
 
 		 515 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  27.7 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  29.45 
 
 		 525 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  28.81 
 
 		 488 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  28.12 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  28.81 
 
 		 514 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  27.55 
 
 		 547 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  26.31 
 
 		 480 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  26.22 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  28.89 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  26.58 
 
 		 479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.5 
 
 		 489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  31.39 
 
 		 543 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  27.78 
 
 		 532 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  30.79 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  26.06 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  29.98 
 
 		 552 aa  134  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  25.58 
 
 		 479 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.82 
 
 		 546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  27.49 
 
 		 487 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  25.18 
 
 		 536 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  28.5 
 
 		 504 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  27.04 
 
 		 536 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  26.09 
 
 		 570 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  30.21 
 
 		 530 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  28.02 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  27.38 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  25.78 
 
 		 500 aa  117  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  26.27 
 
 		 525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.88 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.58 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  24.86 
 
 		 533 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  29.83 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  27.27 
 
 		 532 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  27.84 
 
 		 534 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  24.72 
 
 		 492 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  25.17 
 
 		 538 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  27.11 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  23.99 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  24.86 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  28.06 
 
 		 630 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  26.48 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  27.36 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  24.53 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  30.99 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.79 
 
 		 532 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  32.26 
 
 		 578 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.62 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  26.91 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  23.38 
 
 		 481 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>