80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4978 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1054    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  49.52 
 
 		 517 aa  465  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  47.31 
 
 		 526 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  46.39 
 
 		 525 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  42.28 
 
 		 528 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  39.38 
 
 		 532 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  41.33 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  35.9 
 
 		 543 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  37.04 
 
 		 526 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  34.47 
 
 		 530 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  33.75 
 
 		 552 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  33.27 
 
 		 525 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  31.55 
 
 		 504 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  29.43 
 
 		 508 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  31.18 
 
 		 513 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  30.54 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  29.62 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  29.45 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  29.53 
 
 		 533 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  29.31 
 
 		 509 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  28.34 
 
 		 524 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  31.14 
 
 		 474 aa  160  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  30.65 
 
 		 505 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  28.77 
 
 		 486 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  31.72 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  30.53 
 
 		 476 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  29.91 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  28.57 
 
 		 498 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  28.8 
 
 		 520 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  30.09 
 
 		 515 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  27.9 
 
 		 498 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  31.34 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  27.78 
 
 		 540 aa  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.99 
 
 		 489 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  28.81 
 
 		 511 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  28.89 
 
 		 528 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  28.04 
 
 		 482 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  29.89 
 
 		 508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  30.09 
 
 		 533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  30.96 
 
 		 483 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  26.54 
 
 		 492 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  27.74 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  26.69 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  26.31 
 
 		 536 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  28.83 
 
 		 515 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  27.34 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  28.1 
 
 		 506 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  28.23 
 
 		 510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  27.16 
 
 		 522 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  26.79 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  28.02 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  26.74 
 
 		 547 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.68 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  24.32 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.18 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  29.06 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  28.39 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  29.15 
 
 		 504 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  27.07 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  29.23 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  26.67 
 
 		 500 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  24.66 
 
 		 541 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.43 
 
 		 536 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  25.42 
 
 		 538 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  26.13 
 
 		 532 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  24.09 
 
 		 534 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  23.21 
 
 		 518 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  26.98 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.22 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  26.65 
 
 		 570 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  25.53 
 
 		 531 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  25.14 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  27.72 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  24.82 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  25.79 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  23.62 
 
 		 484 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  24.54 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  24.43 
 
 		 473 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  20.59 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  30.39 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>