83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3035 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1075    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  54.19 
 
 
529 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  38.24 
 
 
528 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  34.31 
 
 
506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  35.86 
 
 
498 aa  269  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  35.08 
 
 
525 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  36.81 
 
 
540 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  36.11 
 
 
510 aa  259  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  38.46 
 
 
514 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  35.82 
 
 
513 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  32.55 
 
 
511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  32.14 
 
 
510 aa  239  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  34 
 
 
508 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  32.66 
 
 
505 aa  237  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  32.09 
 
 
504 aa  234  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  33.89 
 
 
524 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  32.91 
 
 
520 aa  224  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  32.48 
 
 
509 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  31.41 
 
 
498 aa  190  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  30.7 
 
 
474 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  28.08 
 
 
486 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  28.85 
 
 
526 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  28.41 
 
 
483 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  29.72 
 
 
508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  27.37 
 
 
528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  27.54 
 
 
492 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  29.03 
 
 
482 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  30.62 
 
 
514 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  27.89 
 
 
488 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  28.33 
 
 
476 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  30.64 
 
 
481 aa  140  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  27.61 
 
 
489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  28.35 
 
 
543 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  28.14 
 
 
546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  28.39 
 
 
488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  28.15 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  26.33 
 
 
482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  29.51 
 
 
525 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  26.49 
 
 
547 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  30.07 
 
 
504 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  27.01 
 
 
522 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  28.12 
 
 
526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  25.18 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  25.49 
 
 
570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  26.95 
 
 
489 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  25.31 
 
 
530 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  27.34 
 
 
532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  27.74 
 
 
552 aa  114  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  28.16 
 
 
515 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.03 
 
 
499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  27.19 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  24.25 
 
 
518 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  26.59 
 
 
525 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  24.73 
 
 
479 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  25 
 
 
480 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  26.16 
 
 
487 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  26.72 
 
 
487 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  28.47 
 
 
479 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  25.56 
 
 
541 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  28.01 
 
 
463 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  25.35 
 
 
531 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  25.83 
 
 
500 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  23.82 
 
 
536 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  23.39 
 
 
533 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  25.41 
 
 
534 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  23.05 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  24.11 
 
 
534 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  24.7 
 
 
536 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  24.14 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  24.57 
 
 
472 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  23.24 
 
 
630 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  23.91 
 
 
478 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  23.95 
 
 
484 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  24.4 
 
 
541 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.2 
 
 
474 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  30.17 
 
 
476 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  31.4 
 
 
538 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  29.74 
 
 
473 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  23.75 
 
 
481 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  30.48 
 
 
446 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  25.32 
 
 
578 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.45 
 
 
492 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  30.85 
 
 
476 aa  43.9  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>