84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3947 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1056    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  79.84 
 
 
513 aa  833    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  52.41 
 
 
510 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  51.27 
 
 
508 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  45.45 
 
 
498 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  39.92 
 
 
528 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  37.94 
 
 
504 aa  320  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  44.29 
 
 
540 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  36.97 
 
 
525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  36.4 
 
 
520 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  37.24 
 
 
524 aa  289  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  36.6 
 
 
511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  36.93 
 
 
506 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  34.74 
 
 
505 aa  269  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  37.15 
 
 
509 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  33.46 
 
 
510 aa  249  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  39.47 
 
 
529 aa  249  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  38.46 
 
 
533 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  35.94 
 
 
481 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  32.29 
 
 
498 aa  193  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  31.75 
 
 
482 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  30 
 
 
508 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  31.03 
 
 
476 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  30.84 
 
 
526 aa  180  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  29.48 
 
 
514 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  30.86 
 
 
474 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  28.31 
 
 
500 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  28.08 
 
 
486 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  30.19 
 
 
487 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  27.51 
 
 
479 aa  160  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  26.23 
 
 
492 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  28.92 
 
 
517 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  29.25 
 
 
483 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  30.8 
 
 
504 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  27.79 
 
 
522 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  27.94 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  28.25 
 
 
488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  28.49 
 
 
489 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  28.54 
 
 
525 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  27.02 
 
 
547 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  27.24 
 
 
489 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  27.39 
 
 
515 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  26.61 
 
 
552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  26.63 
 
 
480 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  26.68 
 
 
532 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  27.09 
 
 
482 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  25 
 
 
518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  28.5 
 
 
543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  27.44 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  27.48 
 
 
526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  28.57 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.54 
 
 
536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  27.12 
 
 
531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  27.98 
 
 
488 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  30.84 
 
 
538 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  26.76 
 
 
487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  28 
 
 
515 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.65 
 
 
533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.17 
 
 
546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  26.2 
 
 
570 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  28.63 
 
 
479 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  24.86 
 
 
536 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  26.76 
 
 
463 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  27.22 
 
 
474 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  24.82 
 
 
532 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.14 
 
 
499 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  28.67 
 
 
500 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  25.56 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  24.63 
 
 
525 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.63 
 
 
478 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  24.59 
 
 
472 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.32 
 
 
473 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  25.75 
 
 
541 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  32.6 
 
 
630 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  25.85 
 
 
532 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  23.4 
 
 
578 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  24.64 
 
 
534 aa  67  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  23.4 
 
 
492 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  40.66 
 
 
446 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  25.83 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  22.3 
 
 
534 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  33.94 
 
 
476 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  22.77 
 
 
566 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  24.15 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>