84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6879 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  980    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  45.06 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  44.09 
 
 		 488 aa  359  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  34.88 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  35.23 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  33.6 
 
 		 486 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  32.45 
 
 		 480 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  32.3 
 
 		 515 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  31.35 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  32.85 
 
 		 481 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  31.11 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  31.62 
 
 		 525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  30.08 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  33.16 
 
 		 489 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  28 
 
 		 508 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  28.54 
 
 		 492 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  29.33 
 
 		 504 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  28.54 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  27.97 
 
 		 504 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  29.48 
 
 		 498 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.61 
 
 		 520 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  25.58 
 
 		 511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  27.22 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  29.49 
 
 		 508 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  28.6 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  26.63 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  27.72 
 
 		 524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  26.8 
 
 		 510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  26.3 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  25.86 
 
 		 522 aa  126  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  27.68 
 
 		 482 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  27.48 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  28.04 
 
 		 526 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  26.47 
 
 		 517 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  28.63 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  27.54 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  25.23 
 
 		 518 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  27.96 
 
 		 540 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  27.21 
 
 		 513 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  27.43 
 
 		 525 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  27.62 
 
 		 536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  26.19 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  28.39 
 
 		 514 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.56 
 
 		 532 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  26.33 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  26.95 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  28.15 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  28.71 
 
 		 543 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  25.47 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.19 
 
 		 533 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  26.37 
 
 		 529 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  28.85 
 
 		 533 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25.36 
 
 		 534 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  29.47 
 
 		 546 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  27.39 
 
 		 506 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  27.41 
 
 		 532 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  27.02 
 
 		 534 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  28.29 
 
 		 499 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  23.81 
 
 		 489 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  25.86 
 
 		 528 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  24.91 
 
 		 536 aa  93.2  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  26.01 
 
 		 532 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  29.17 
 
 		 446 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  27.81 
 
 		 552 aa  90.5  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  27.25 
 
 		 541 aa  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  26.65 
 
 		 538 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  27.95 
 
 		 526 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  23.4 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  28.12 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  25.5 
 
 		 530 aa  83.2  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.1 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.49 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  25.05 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  24.93 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  23.92 
 
 		 578 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.51 
 
 		 474 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  29.1 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  23.14 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  25.14 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  23.05 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  23.88 
 
 		 525 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  34.03 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 506 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 603 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>