85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6040 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  984    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  44.44 
 
 
492 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  40.45 
 
 
476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  36.76 
 
 
474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  36.19 
 
 
508 aa  269  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  36.49 
 
 
504 aa  246  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  32.68 
 
 
489 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  32.46 
 
 
479 aa  212  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  29.87 
 
 
500 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  36.03 
 
 
482 aa  206  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  32.09 
 
 
487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  31.5 
 
 
546 aa  196  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  34.64 
 
 
481 aa  196  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  31.16 
 
 
547 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  31.37 
 
 
511 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  31.93 
 
 
504 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  30.08 
 
 
486 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  30.29 
 
 
522 aa  190  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  30.75 
 
 
518 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  30.67 
 
 
505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  30.27 
 
 
540 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  30.34 
 
 
525 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  30.15 
 
 
482 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  29.6 
 
 
506 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  30.46 
 
 
480 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  31.91 
 
 
489 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  29.84 
 
 
488 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  30.31 
 
 
531 aa  173  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  30.42 
 
 
479 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  29.2 
 
 
536 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  30.65 
 
 
498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  30.24 
 
 
515 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  29.87 
 
 
515 aa  162  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  30.21 
 
 
533 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  29.29 
 
 
510 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  27.43 
 
 
509 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  30.21 
 
 
510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  27.01 
 
 
529 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  28 
 
 
528 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  29.77 
 
 
513 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  29.66 
 
 
524 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  28.46 
 
 
517 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  28.03 
 
 
543 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  27.69 
 
 
533 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  29.11 
 
 
514 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  28.49 
 
 
508 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  28.25 
 
 
525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.9 
 
 
520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  27.45 
 
 
488 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  29.66 
 
 
498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  32.13 
 
 
528 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  31.45 
 
 
487 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  28.7 
 
 
526 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  29.34 
 
 
538 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  28.02 
 
 
526 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  30.96 
 
 
514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  26.69 
 
 
536 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  27.44 
 
 
525 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  27.39 
 
 
534 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  26.89 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  27.03 
 
 
492 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  29.5 
 
 
530 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  27.04 
 
 
500 aa  126  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  28.4 
 
 
463 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  27.94 
 
 
552 aa  123  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  26.64 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  24.46 
 
 
541 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  32.91 
 
 
570 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  26.36 
 
 
484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.28 
 
 
499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  24.91 
 
 
532 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  27.06 
 
 
532 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  25.81 
 
 
446 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  26.12 
 
 
478 aa  106  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  26.13 
 
 
534 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  24.76 
 
 
474 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  29.17 
 
 
481 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  27.12 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  24.49 
 
 
539 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  22.74 
 
 
578 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.2 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  25.54 
 
 
476 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  29.7 
 
 
630 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  26.32 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 
506 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>