74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3960 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  971    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  48.06 
 
 
473 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  44.07 
 
 
478 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  32.75 
 
 
472 aa  192  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  27.18 
 
 
463 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  27.64 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  26.58 
 
 
500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  28.16 
 
 
513 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.63 
 
 
487 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  28.19 
 
 
489 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  28.08 
 
 
514 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  26.69 
 
 
482 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  27.75 
 
 
510 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  26.33 
 
 
486 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  28.93 
 
 
498 aa  99.8  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  28.99 
 
 
481 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  24.45 
 
 
492 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  26.89 
 
 
476 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  26.38 
 
 
532 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  26.34 
 
 
482 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  26.41 
 
 
483 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  24.81 
 
 
504 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  23.95 
 
 
536 aa  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  29.49 
 
 
578 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  24.38 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  27.2 
 
 
506 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  25.76 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  25.64 
 
 
474 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  25.95 
 
 
508 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.07 
 
 
489 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  24.52 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  24.9 
 
 
479 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  25.33 
 
 
515 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  26.1 
 
 
498 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  24.31 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  25 
 
 
500 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  25.19 
 
 
515 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  24.06 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  25.95 
 
 
487 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  23.75 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  26.07 
 
 
529 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  25.88 
 
 
480 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  27 
 
 
511 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  25.37 
 
 
522 aa  70.1  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  25.45 
 
 
510 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  25.18 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  24.83 
 
 
540 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  23.3 
 
 
499 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  24.87 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  26.18 
 
 
547 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  24.81 
 
 
518 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  26.01 
 
 
528 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  25.61 
 
 
533 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  24.51 
 
 
543 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  24.45 
 
 
520 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  25.79 
 
 
517 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  25.29 
 
 
526 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  23.4 
 
 
508 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  24.77 
 
 
528 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  28.7 
 
 
570 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  22.86 
 
 
525 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  24.22 
 
 
484 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  25.41 
 
 
476 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  23.27 
 
 
476 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25 
 
 
534 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  24.49 
 
 
546 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  23.8 
 
 
532 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  23.44 
 
 
524 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  22.48 
 
 
530 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  24.09 
 
 
552 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  25.06 
 
 
538 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  24.58 
 
 
504 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  22.7 
 
 
536 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  25.23 
 
 
481 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>