84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0968 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1038    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  70.75 
 
 		 508 aa  761    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  36.76 
 
 		 483 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  36.33 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  35.59 
 
 		 476 aa  269  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  37.45 
 
 		 492 aa  267  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  35.99 
 
 		 489 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  33.99 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  30.13 
 
 		 500 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  31.89 
 
 		 546 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  32.83 
 
 		 547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  31.53 
 
 		 487 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  30.5 
 
 		 504 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  30.17 
 
 		 488 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  29.96 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  30.26 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  31.56 
 
 		 481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  29.12 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  30.8 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  30.73 
 
 		 518 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  29.34 
 
 		 486 aa  180  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  30.49 
 
 		 513 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  30.73 
 
 		 514 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  29.98 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  30.33 
 
 		 538 aa  169  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  30.1 
 
 		 525 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  29.58 
 
 		 526 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  28.3 
 
 		 479 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  30.43 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  30.43 
 
 		 506 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  29.94 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  29.54 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  28.19 
 
 		 540 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  28.75 
 
 		 515 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  27.79 
 
 		 480 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  28.35 
 
 		 498 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  28.47 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  30.91 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  27.99 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  27.44 
 
 		 524 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  26.62 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  27.96 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  28.26 
 
 		 529 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  29.47 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  29.18 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  28.84 
 
 		 533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  29.58 
 
 		 489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.84 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  27.2 
 
 		 528 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  27.24 
 
 		 534 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  29.46 
 
 		 525 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  28.49 
 
 		 514 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.75 
 
 		 533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  25.71 
 
 		 536 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  31.25 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  27.11 
 
 		 500 aa  121  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  27.41 
 
 		 499 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  26.09 
 
 		 541 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  26.3 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  27.62 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  26.93 
 
 		 532 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  25.93 
 
 		 543 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  27.2 
 
 		 517 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  26.42 
 
 		 532 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  27.67 
 
 		 530 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  26.76 
 
 		 463 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  24.57 
 
 		 552 aa  100  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  26.59 
 
 		 525 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  26.56 
 
 		 534 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  25.69 
 
 		 526 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.31 
 
 		 492 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  26.19 
 
 		 541 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  23.68 
 
 		 484 aa  90.1  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  26.96 
 
 		 578 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  26.16 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  25.75 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  28.41 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  23.34 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  26.72 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  24.95 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  25.15 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  26.2 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  24.78 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  27.2 
 
 		 630 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>