84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6734 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1119    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  42.4 
 
 		 526 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  42.37 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  37.5 
 
 		 525 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  35.87 
 
 		 552 aa  290  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  35.9 
 
 		 514 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  35.99 
 
 		 517 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  34.35 
 
 		 525 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  33.27 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  33.7 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  31.06 
 
 		 532 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  31.83 
 
 		 541 aa  207  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  29.21 
 
 		 504 aa  163  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  29.72 
 
 		 525 aa  156  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  31.55 
 
 		 508 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  28.03 
 
 		 483 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  33.17 
 
 		 506 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  30.98 
 
 		 481 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  27.82 
 
 		 509 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  28.19 
 
 		 492 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  30 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  31.13 
 
 		 474 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  26.26 
 
 		 498 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  31.39 
 
 		 511 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  26.34 
 
 		 529 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  27.67 
 
 		 528 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  27.08 
 
 		 505 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  28.57 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  25.62 
 
 		 510 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  31.35 
 
 		 489 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  31.69 
 
 		 540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  30.2 
 
 		 476 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  29.31 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  28.74 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  30.45 
 
 		 522 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  27.81 
 
 		 498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.09 
 
 		 533 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.96 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  31.21 
 
 		 500 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  26.1 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  27.44 
 
 		 513 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  26.06 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.22 
 
 		 489 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  25.77 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  22.93 
 
 		 536 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  24.87 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  28.4 
 
 		 534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.21 
 
 		 546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  28.29 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  28.16 
 
 		 488 aa  110  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  24.01 
 
 		 547 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  27.15 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  27.33 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  28.47 
 
 		 479 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  25.36 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.96 
 
 		 499 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  26.47 
 
 		 488 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  27.82 
 
 		 518 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  22.95 
 
 		 446 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  23.17 
 
 		 515 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  25.57 
 
 		 630 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  25.93 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  26.91 
 
 		 532 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  22.72 
 
 		 515 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25.12 
 
 		 534 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  25.59 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  24.49 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  24.07 
 
 		 472 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  25.49 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.21 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.51 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  23.76 
 
 		 484 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  22.73 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  23.4 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  23.34 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.43 
 
 		 536 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  24.64 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  23.72 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  27 
 
 		 570 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  23.52 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  23.46 
 
 		 539 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  30.39 
 
 		 481 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  22.82 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  21.92 
 
 		 578 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>