84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6728 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1081    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  54.19 
 
 		 533 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  40.15 
 
 		 528 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  37.77 
 
 		 540 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  35.49 
 
 		 504 aa  276  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  38.07 
 
 		 510 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  35.42 
 
 		 508 aa  274  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  35.58 
 
 		 510 aa  269  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  35.77 
 
 		 525 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  35.47 
 
 		 513 aa  267  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  39.71 
 
 		 514 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  34 
 
 		 511 aa  257  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  34.9 
 
 		 506 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  34.55 
 
 		 520 aa  246  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  33.96 
 
 		 505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  34.13 
 
 		 524 aa  243  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  33.58 
 
 		 498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  31.44 
 
 		 498 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  29.42 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  31.14 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  31.87 
 
 		 482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  31.95 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  29.74 
 
 		 508 aa  163  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  27.56 
 
 		 482 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  27.36 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  28.31 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  28.88 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  27.46 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  26.14 
 
 		 526 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  27.57 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  27.21 
 
 		 543 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  26.55 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  28.37 
 
 		 517 aa  144  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  28.62 
 
 		 546 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  27.79 
 
 		 526 aa  143  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  28.96 
 
 		 525 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  27.7 
 
 		 570 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  26.76 
 
 		 486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  29.98 
 
 		 504 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  27.19 
 
 		 541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  27.07 
 
 		 547 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  27.42 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  27.66 
 
 		 514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  28.1 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  25.57 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  27.65 
 
 		 552 aa  128  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  26.27 
 
 		 515 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  28.17 
 
 		 532 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.45 
 
 		 489 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  30.86 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  25.84 
 
 		 530 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  27.25 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  28.54 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  24.61 
 
 		 525 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  24.5 
 
 		 480 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  25.31 
 
 		 531 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.21 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  26.39 
 
 		 536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.03 
 
 		 487 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  27.47 
 
 		 479 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  23.85 
 
 		 533 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  24.61 
 
 		 500 aa  99.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  26.24 
 
 		 463 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  25.65 
 
 		 534 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  25.09 
 
 		 484 aa  90.1  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  24.07 
 
 		 532 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.82 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  24.54 
 
 		 538 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  24.69 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.67 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  23.73 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  24.08 
 
 		 630 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  26.15 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  22.94 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  34.32 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  24.87 
 
 		 492 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  25.15 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  31.13 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  24.66 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  30.7 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  24.17 
 
 		 578 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  24.52 
 
 		 539 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  27.96 
 
 		 476 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>