83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0404 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  1006    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  44.86 
 
 
479 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  40.94 
 
 
488 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  31.47 
 
 
476 aa  230  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  34.72 
 
 
474 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  33.68 
 
 
481 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  32.91 
 
 
482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  31.95 
 
 
480 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  30.43 
 
 
486 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  31.18 
 
 
515 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  30.83 
 
 
492 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  29.89 
 
 
515 aa  183  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  29.69 
 
 
508 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  30.06 
 
 
483 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  29.61 
 
 
526 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  29.69 
 
 
525 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  29.94 
 
 
498 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  29.35 
 
 
510 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  29.39 
 
 
504 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  29.91 
 
 
514 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  28.81 
 
 
511 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  27.26 
 
 
508 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  27.66 
 
 
504 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  26.69 
 
 
536 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  29.23 
 
 
524 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  26.88 
 
 
479 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  28.35 
 
 
514 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.08 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  26.87 
 
 
540 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  28.26 
 
 
533 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  27.92 
 
 
482 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  30.69 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  28.28 
 
 
546 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  30.36 
 
 
498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  27.31 
 
 
506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  26.92 
 
 
513 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  32.41 
 
 
517 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  27.58 
 
 
525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  25.47 
 
 
510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  32.15 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  27.36 
 
 
489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  26.1 
 
 
509 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  28.07 
 
 
489 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  27.26 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  28.22 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  24.36 
 
 
522 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  27.37 
 
 
547 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  32.24 
 
 
484 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  25.6 
 
 
518 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  29.74 
 
 
529 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  25.19 
 
 
500 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  26.3 
 
 
532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  27.74 
 
 
487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  25.66 
 
 
500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  28.16 
 
 
543 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  28.17 
 
 
499 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  24.51 
 
 
487 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  25.62 
 
 
533 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  25.55 
 
 
532 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  29.43 
 
 
526 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  28.97 
 
 
534 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  27.7 
 
 
541 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  26.3 
 
 
534 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  25.23 
 
 
552 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  24.24 
 
 
532 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.8 
 
 
492 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  26.5 
 
 
525 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25 
 
 
536 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  27.04 
 
 
530 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  25.1 
 
 
463 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  24.55 
 
 
531 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  26.46 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  30.47 
 
 
446 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  28.01 
 
 
473 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  23.93 
 
 
538 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.65 
 
 
474 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  27.73 
 
 
472 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  29.07 
 
 
630 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  24.32 
 
 
481 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  25.24 
 
 
570 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  24.59 
 
 
578 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  25.75 
 
 
476 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  26.78 
 
 
476 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>