84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5277 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1038    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  55.53 
 
 		 522 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  52.02 
 
 		 518 aa  518  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  29.92 
 
 		 483 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  28.41 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  30.13 
 
 		 504 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  28.98 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  29.49 
 
 		 476 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  29.13 
 
 		 474 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  28.44 
 
 		 504 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  29.89 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  29.39 
 
 		 489 aa  183  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  30.52 
 
 		 528 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  28.21 
 
 		 479 aa  176  8e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  29.42 
 
 		 547 aa  176  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  30.52 
 
 		 481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  29.42 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  29.24 
 
 		 546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  28.43 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  28.12 
 
 		 514 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  28.54 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  27.87 
 
 		 487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  26.89 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  26.42 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  28.16 
 
 		 524 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  28.2 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  27.86 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  27.81 
 
 		 509 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  26.22 
 
 		 513 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  26.67 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  26.65 
 
 		 540 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  27.57 
 
 		 529 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  28.43 
 
 		 498 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  26.48 
 
 		 508 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  26.68 
 
 		 488 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  26.84 
 
 		 505 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  25.54 
 
 		 515 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  28.14 
 
 		 541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  27.44 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  27.87 
 
 		 532 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  25.67 
 
 		 480 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  26.63 
 
 		 479 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  26.52 
 
 		 482 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  25.83 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  26.52 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  25.98 
 
 		 489 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  26.31 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  25.27 
 
 		 531 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  31.21 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  25.19 
 
 		 488 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  25.18 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  26.22 
 
 		 532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  26.64 
 
 		 538 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  27.24 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  25.65 
 
 		 525 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  24.01 
 
 		 500 aa  106  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  25.85 
 
 		 525 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  24.05 
 
 		 536 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  24.49 
 
 		 526 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  24.82 
 
 		 528 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.14 
 
 		 536 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  26.77 
 
 		 552 aa  100  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  26.67 
 
 		 514 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  24.18 
 
 		 533 aa  94.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  25.74 
 
 		 570 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  26.24 
 
 		 530 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  24.66 
 
 		 534 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  23.55 
 
 		 463 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  23.16 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  23.87 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  22.7 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  22.62 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  22.87 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  24.81 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  25.52 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  22.71 
 
 		 484 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  26.27 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  25.55 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  26.42 
 
 		 630 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  23.03 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  25.23 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  28.85 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  24.35 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.18 
 
 		 473 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>