84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2722 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  70.19 
 
 
481 aa  681    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  985    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  35.22 
 
 
515 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  36.88 
 
 
515 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  35.07 
 
 
474 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  34.01 
 
 
476 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  32.6 
 
 
488 aa  220  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  33.53 
 
 
504 aa  213  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  32.84 
 
 
540 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  36.03 
 
 
483 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  32.87 
 
 
492 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  30.71 
 
 
511 aa  203  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  35.37 
 
 
510 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  32.32 
 
 
508 aa  197  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  35.12 
 
 
509 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  33.02 
 
 
525 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  30.82 
 
 
479 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  33.33 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  30.67 
 
 
508 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  32.5 
 
 
513 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  30.82 
 
 
486 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  30.23 
 
 
510 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  31.47 
 
 
506 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  31.62 
 
 
514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  32.8 
 
 
498 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  29.78 
 
 
498 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  29.47 
 
 
520 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  31.77 
 
 
487 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  30.45 
 
 
524 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  29.96 
 
 
522 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  30.16 
 
 
480 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  29.62 
 
 
479 aa  170  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  32.56 
 
 
482 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  28.52 
 
 
500 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  27.9 
 
 
488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  30.11 
 
 
518 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  30.06 
 
 
504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  32.11 
 
 
528 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  28.54 
 
 
489 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  31.71 
 
 
529 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  31.72 
 
 
514 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  30.77 
 
 
517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  30.1 
 
 
463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  29.1 
 
 
526 aa  153  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  29.23 
 
 
533 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  29.36 
 
 
489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  30.41 
 
 
543 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  32.33 
 
 
526 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  28.84 
 
 
531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  27.63 
 
 
487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  28.54 
 
 
499 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  29.15 
 
 
530 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  27.32 
 
 
500 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  25.36 
 
 
546 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  26.63 
 
 
547 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  32.27 
 
 
525 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  27.61 
 
 
532 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  29.95 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  28.72 
 
 
446 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  27.47 
 
 
538 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.82 
 
 
532 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  27.19 
 
 
536 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  27.53 
 
 
541 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.36 
 
 
536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  26.21 
 
 
534 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.02 
 
 
533 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.2 
 
 
492 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  28.3 
 
 
484 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  25.58 
 
 
541 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  27.65 
 
 
525 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  27.43 
 
 
552 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  25.89 
 
 
472 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  26.41 
 
 
474 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  29.81 
 
 
570 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  25.23 
 
 
532 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  25.05 
 
 
478 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  24.29 
 
 
578 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25.63 
 
 
534 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  23.38 
 
 
473 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  28.46 
 
 
630 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  26.98 
 
 
481 aa  60.1  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  24.93 
 
 
476 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  22.18 
 
 
539 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  23.05 
 
 
476 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>