79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0615 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  1088    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  51.74 
 
 
517 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  49.71 
 
 
525 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  42.28 
 
 
514 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  39.17 
 
 
526 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  37.22 
 
 
541 aa  300  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  36.35 
 
 
532 aa  289  8e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  35.37 
 
 
526 aa  266  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  33.27 
 
 
543 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  31.83 
 
 
530 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  35.1 
 
 
552 aa  199  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  30.71 
 
 
525 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  29.96 
 
 
504 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  28.86 
 
 
525 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  27.37 
 
 
509 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  31.78 
 
 
513 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  29.78 
 
 
540 aa  163  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  30.71 
 
 
474 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  27.08 
 
 
511 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  28.82 
 
 
524 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  27.97 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  28.11 
 
 
508 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.88 
 
 
520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  27.43 
 
 
508 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  29.13 
 
 
528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  29.08 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  26.15 
 
 
492 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  29.24 
 
 
514 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  27.29 
 
 
505 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  27.44 
 
 
486 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  26.85 
 
 
533 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  28.15 
 
 
529 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  27.17 
 
 
498 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  28.92 
 
 
515 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  31.77 
 
 
481 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  27.12 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  26.22 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  26.64 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  29.95 
 
 
482 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  26.06 
 
 
482 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  25.77 
 
 
533 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  27.34 
 
 
515 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  28.4 
 
 
510 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  27.85 
 
 
488 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  26.51 
 
 
522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  26.2 
 
 
506 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  27.87 
 
 
504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  26.45 
 
 
510 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.27 
 
 
489 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  26.29 
 
 
547 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  26.81 
 
 
487 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  25.42 
 
 
479 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  24.82 
 
 
500 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  25 
 
 
489 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  25.79 
 
 
546 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  27.81 
 
 
488 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  25.94 
 
 
479 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  24.09 
 
 
500 aa  88.2  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.63 
 
 
532 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  22.78 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  23.32 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  27.05 
 
 
473 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  26.73 
 
 
534 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  25.64 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  23.46 
 
 
484 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.92 
 
 
499 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  23.81 
 
 
536 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  24.03 
 
 
472 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  25 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  23.87 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  23.89 
 
 
630 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  25.75 
 
 
541 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  25.23 
 
 
532 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  27.6 
 
 
570 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  23.78 
 
 
463 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  24.86 
 
 
538 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  24.87 
 
 
534 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  26.42 
 
 
476 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  24.23 
 
 
474 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>