82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0612 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  100 
 
 
515 aa  1051    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  65.82 
 
 
515 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  37.43 
 
 
481 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  37.04 
 
 
482 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  32.89 
 
 
474 aa  216  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  33.78 
 
 
486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  32.57 
 
 
476 aa  203  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  31.35 
 
 
479 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  31.18 
 
 
488 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  29.51 
 
 
492 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  31.22 
 
 
504 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  30.21 
 
 
488 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  30.81 
 
 
480 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  30.56 
 
 
483 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  29.54 
 
 
525 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  31.48 
 
 
511 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  30.23 
 
 
526 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  30.09 
 
 
514 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  29.32 
 
 
541 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  29.65 
 
 
482 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  25.74 
 
 
522 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  27.53 
 
 
525 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  28.42 
 
 
508 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  28.62 
 
 
528 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  30 
 
 
514 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  27.45 
 
 
508 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  28.04 
 
 
517 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  27.44 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  27.42 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  26.26 
 
 
510 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  28.41 
 
 
487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  28.36 
 
 
504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  27.52 
 
 
509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  27.36 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  28.03 
 
 
498 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.54 
 
 
520 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  26.4 
 
 
513 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  29.81 
 
 
510 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  26.11 
 
 
506 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  26.11 
 
 
479 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  27.29 
 
 
529 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  27.39 
 
 
489 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  26.88 
 
 
536 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  26.84 
 
 
498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  26.93 
 
 
524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  29.18 
 
 
528 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.92 
 
 
487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  27.43 
 
 
533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.53 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  26.25 
 
 
489 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  29.04 
 
 
526 aa  110  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  23.26 
 
 
518 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  27.37 
 
 
531 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  24.96 
 
 
532 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  25.75 
 
 
547 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  22.72 
 
 
543 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  25.48 
 
 
463 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.04 
 
 
532 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  26.04 
 
 
552 aa  88.2  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  24.16 
 
 
530 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  28.15 
 
 
570 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  25.57 
 
 
546 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  26.55 
 
 
536 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  25.79 
 
 
578 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  24.19 
 
 
525 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  24.27 
 
 
538 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.11 
 
 
474 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  23.76 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  22.48 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  25.42 
 
 
472 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.6 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  26.06 
 
 
630 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  23.46 
 
 
532 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  25.58 
 
 
534 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  24.81 
 
 
473 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  23.76 
 
 
499 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  24.3 
 
 
534 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  26.21 
 
 
500 aa  60.5  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  22.34 
 
 
541 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  24.5 
 
 
484 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  21.85 
 
 
539 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  23.11 
 
 
481 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>