83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2769 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1060    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  37.72 
 
 		 505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  37.82 
 
 		 513 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  34.03 
 
 		 504 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  38.55 
 
 		 540 aa  266  8e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  36.78 
 
 		 514 aa  266  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  34.17 
 
 		 510 aa  257  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  34.58 
 
 		 528 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  35.24 
 
 		 520 aa  252  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  35.7 
 
 		 508 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  34.23 
 
 		 524 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  32.37 
 
 		 506 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  32.29 
 
 		 498 aa  226  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  31.76 
 
 		 525 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  32.44 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  32.33 
 
 		 510 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  31.5 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 529 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  31.44 
 
 		 498 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  35.8 
 
 		 481 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  30.46 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  35.12 
 
 		 482 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  27.67 
 
 		 474 aa  176  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  27.37 
 
 		 528 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  29.16 
 
 		 476 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  28.82 
 
 		 492 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  29.69 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  29.31 
 
 		 514 aa  163  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  28.27 
 
 		 517 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  27.78 
 
 		 541 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  27.85 
 
 		 508 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  29.45 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  29.61 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  26.35 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  27.81 
 
 		 500 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  26.4 
 
 		 526 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  27.82 
 
 		 543 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  29.37 
 
 		 525 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  26.94 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  25.09 
 
 		 536 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  27.67 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  24.72 
 
 		 533 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.38 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  29.57 
 
 		 504 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  26.42 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  28.26 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  28.71 
 
 		 482 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  26.89 
 
 		 479 aa  130  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  26.1 
 
 		 488 aa  129  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  27.52 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  30.25 
 
 		 552 aa  128  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  26.3 
 
 		 479 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  30.18 
 
 		 499 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  27.52 
 
 		 487 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.08 
 
 		 546 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  26.34 
 
 		 518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  26.32 
 
 		 515 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  26.93 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.72 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  26.44 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  25.4 
 
 		 531 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  27.1 
 
 		 532 aa  116  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  25.1 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.96 
 
 		 536 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  25.5 
 
 		 570 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  25.48 
 
 		 500 aa  96.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  28.72 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.26 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  30.19 
 
 		 630 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  24.54 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  26.29 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  26.22 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  25.15 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.64 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  24.52 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  22.02 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  23.9 
 
 		 578 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.41 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  22.59 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  24.1 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  32.17 
 
 		 476 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  35.56 
 
 		 476 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>