77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4176 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  68.04 
 
 		 534 aa  769    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  100 
 
 		 532 aa  1097    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  31.78 
 
 		 534 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  31.42 
 
 		 541 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  25.66 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  27.06 
 
 		 483 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  25.81 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  28.11 
 
 		 489 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  24.24 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  25.77 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  25.55 
 
 		 488 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  24.13 
 
 		 526 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  26.84 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  26.82 
 
 		 504 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  26.97 
 
 		 510 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  24.53 
 
 		 487 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  27.27 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  24.16 
 
 		 520 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  27.57 
 
 		 498 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  25 
 
 		 524 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  26.91 
 
 		 543 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  26.01 
 
 		 479 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  27.17 
 
 		 526 aa  90.1  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  25.41 
 
 		 525 aa  90.1  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  24.2 
 
 		 522 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  26.27 
 
 		 474 aa  87.8  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  26.57 
 
 		 504 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  23.94 
 
 		 508 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  24.82 
 
 		 500 aa  86.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  25.38 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  25.92 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  28.84 
 
 		 538 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  26.91 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  25.62 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  26.12 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  24.6 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  25.69 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  26.19 
 
 		 517 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  25.98 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  24.12 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  24.66 
 
 		 529 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  26.54 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  25.13 
 
 		 531 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  22.02 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  22.44 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  23.38 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  24.63 
 
 		 540 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  22.87 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  22.78 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  23.88 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  23.66 
 
 		 532 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  23.46 
 
 		 515 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  24.36 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  22.7 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  24.86 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  24.82 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  25.85 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  24.17 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  24.58 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  24.3 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  26.28 
 
 		 536 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  24.07 
 
 		 525 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  26.42 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  25.23 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  22.33 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  25.76 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  23.86 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  24.24 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  22.95 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  25.89 
 
 		 630 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  22.65 
 
 		 570 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  21.65 
 
 		 536 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  23.8 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  22.53 
 
 		 515 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  24.68 
 
 		 533 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  23.78 
 
 		 478 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  22 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>