84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3552 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  1018    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  35.82 
 
 		 508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  35.99 
 
 		 504 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  32.59 
 
 		 483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  29.39 
 
 		 546 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  31.03 
 
 		 492 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  29.07 
 
 		 547 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  32.24 
 
 		 476 aa  193  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  31.3 
 
 		 522 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  30.31 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  29.39 
 
 		 500 aa  183  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  30.58 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  26.98 
 
 		 570 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  27.98 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  31.09 
 
 		 487 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  30.51 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  33.16 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  31.05 
 
 		 504 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  28.54 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  29.61 
 
 		 498 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  27.54 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  27.79 
 
 		 518 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  28.32 
 
 		 536 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  26.9 
 
 		 529 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  28.74 
 
 		 505 aa  146  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  30.04 
 
 		 487 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  26.6 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  28.83 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  27.76 
 
 		 508 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  26.69 
 
 		 513 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  26.5 
 
 		 511 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.25 
 
 		 533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  27.19 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  27.74 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  27.31 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  28.44 
 
 		 526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  26.38 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  27.2 
 
 		 514 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  26.92 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.84 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  27.22 
 
 		 488 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  27.61 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  27.76 
 
 		 482 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  26.32 
 
 		 510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  27.5 
 
 		 525 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  26.79 
 
 		 524 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  26.89 
 
 		 498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  28.37 
 
 		 499 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  27.34 
 
 		 528 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  27.39 
 
 		 515 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  28.79 
 
 		 488 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  29.35 
 
 		 534 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  29.17 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  27.17 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  25.97 
 
 		 463 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  26.22 
 
 		 543 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  26.95 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  25.82 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  26.02 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  25.65 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  26.84 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  29.06 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  26.31 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  28.11 
 
 		 532 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  25.5 
 
 		 532 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  23.94 
 
 		 530 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  25 
 
 		 528 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  24.64 
 
 		 525 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  27 
 
 		 446 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  24.19 
 
 		 526 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  23.75 
 
 		 500 aa  91.3  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  22.39 
 
 		 536 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  28.15 
 
 		 472 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  26.1 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  24.08 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.2 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  29.33 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  24.57 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  28.02 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  28.76 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  23.61 
 
 		 578 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  23.03 
 
 		 539 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  24.12 
 
 		 532 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  25.07 
 
 		 630 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>