84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0202 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  988    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  49.28 
 
 
489 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  31.64 
 
 
482 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  30.63 
 
 
532 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  31.91 
 
 
481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  28.68 
 
 
536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  31.77 
 
 
482 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  31.16 
 
 
479 aa  163  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  30.56 
 
 
476 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  28.95 
 
 
463 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  30.85 
 
 
474 aa  156  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  28.07 
 
 
547 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  27.73 
 
 
492 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  32.57 
 
 
499 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  29.04 
 
 
500 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  29.76 
 
 
446 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  30.31 
 
 
486 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  30.04 
 
 
489 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  29.94 
 
 
508 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  28.89 
 
 
498 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  31.17 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  28.17 
 
 
540 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  27.03 
 
 
504 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  29.77 
 
 
525 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  28.6 
 
 
487 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  28.09 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  26.72 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  28.36 
 
 
510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.98 
 
 
546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  26.34 
 
 
506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  28.82 
 
 
505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  28.39 
 
 
498 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.89 
 
 
520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  30 
 
 
510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  26.78 
 
 
514 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  26.52 
 
 
500 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  27.52 
 
 
509 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  28.96 
 
 
543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  30.58 
 
 
504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  27.7 
 
 
524 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  26.7 
 
 
525 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  28.88 
 
 
511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  26.36 
 
 
522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  27.84 
 
 
541 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  28.92 
 
 
515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  26.05 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  32.87 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  28.39 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  26.63 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  28.08 
 
 
478 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  28.78 
 
 
528 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  27.54 
 
 
479 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  28.68 
 
 
514 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  27.03 
 
 
488 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  24.71 
 
 
513 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  27.09 
 
 
472 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  26.04 
 
 
473 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  25.31 
 
 
536 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  25.48 
 
 
476 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  28.03 
 
 
474 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  26.81 
 
 
528 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  28.98 
 
 
538 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  26.65 
 
 
533 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  27.03 
 
 
552 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  22.87 
 
 
578 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.1 
 
 
492 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  28.05 
 
 
529 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  26.19 
 
 
525 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  26.35 
 
 
518 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  28.53 
 
 
570 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  28.01 
 
 
488 aa  96.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.4 
 
 
533 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  26.63 
 
 
532 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  26.05 
 
 
481 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  24.47 
 
 
531 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  26.15 
 
 
526 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  24.14 
 
 
515 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  24.87 
 
 
530 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  25.11 
 
 
534 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  24.54 
 
 
541 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  24.61 
 
 
539 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  24.58 
 
 
532 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25.94 
 
 
534 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  24.05 
 
 
630 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>