84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04170 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  978    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  35.52 
 
 
508 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  33.72 
 
 
504 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  31.66 
 
 
482 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  32.43 
 
 
483 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  31.06 
 
 
492 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  31.22 
 
 
474 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  31.39 
 
 
476 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  30.31 
 
 
489 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  29.9 
 
 
489 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  28.21 
 
 
500 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  30.62 
 
 
481 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  28.72 
 
 
488 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  28.52 
 
 
522 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  29.96 
 
 
482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  27.15 
 
 
486 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  31.16 
 
 
487 aa  163  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  27.5 
 
 
513 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  29.18 
 
 
526 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  30.11 
 
 
506 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  27.39 
 
 
510 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  28.41 
 
 
525 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  28.57 
 
 
505 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  28.46 
 
 
518 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  26.73 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  27.06 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  29.63 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.57 
 
 
546 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  28.54 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  26.88 
 
 
488 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  28.01 
 
 
480 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  27.29 
 
 
508 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  27.61 
 
 
504 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  30.02 
 
 
510 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  28.76 
 
 
528 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  26.58 
 
 
511 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  27.59 
 
 
498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  27.71 
 
 
517 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  26.74 
 
 
500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  32.35 
 
 
570 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  26.67 
 
 
463 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  27.29 
 
 
487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  27.34 
 
 
514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  26.89 
 
 
509 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  25.76 
 
 
540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  27.06 
 
 
529 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  26.77 
 
 
525 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  26.11 
 
 
515 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  27.22 
 
 
499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  25.79 
 
 
520 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  27.08 
 
 
524 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  26.96 
 
 
552 aa  117  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  25.82 
 
 
515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  25.47 
 
 
533 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  24.87 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  27.04 
 
 
531 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  24.43 
 
 
526 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  26.39 
 
 
532 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  24.91 
 
 
530 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  24.5 
 
 
533 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  25.42 
 
 
528 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  27.29 
 
 
446 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  25.19 
 
 
536 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  27 
 
 
541 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  26.12 
 
 
538 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  23.99 
 
 
532 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.73 
 
 
492 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  25.38 
 
 
484 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  26.32 
 
 
541 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  23.11 
 
 
534 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  26.32 
 
 
536 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  23.44 
 
 
525 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  27.05 
 
 
534 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  25.64 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  25.69 
 
 
532 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  24.9 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  25 
 
 
578 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  25.95 
 
 
539 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  23.3 
 
 
478 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  22.99 
 
 
481 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  20.67 
 
 
473 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  28.24 
 
 
476 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  30.21 
 
 
476 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  25.37 
 
 
630 aa  50.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>