83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1007 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  80.12 
 
 		 514 aa  832    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1054    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  50.58 
 
 		 510 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  50.2 
 
 		 508 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  46.49 
 
 		 498 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  40.04 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  38.97 
 
 		 540 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  37 
 
 		 504 aa  297  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  39.63 
 
 		 524 aa  296  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  37.52 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  36.45 
 
 		 525 aa  287  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  35.71 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  34.99 
 
 		 511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  35.66 
 
 		 529 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  36.43 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  33.65 
 
 		 506 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  31.55 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 510 aa  237  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  36.52 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  32.5 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  31.3 
 
 		 514 aa  187  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  31.26 
 
 		 517 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  30.59 
 
 		 508 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  32.02 
 
 		 487 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  29.7 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  29.73 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  27.66 
 
 		 486 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  29.73 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  29.93 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  28.08 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  27.13 
 
 		 492 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  29.89 
 
 		 483 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  30.78 
 
 		 504 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  26.14 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  28.49 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  30.36 
 
 		 525 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  27.3 
 
 		 552 aa  150  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  27.15 
 
 		 489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  27.22 
 
 		 522 aa  146  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  28.42 
 
 		 489 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  27.02 
 
 		 547 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  27.29 
 
 		 488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  26.55 
 
 		 488 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  27.08 
 
 		 532 aa  136  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  26.73 
 
 		 518 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  26.86 
 
 		 515 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  26.11 
 
 		 480 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  27.47 
 
 		 541 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  27.22 
 
 		 530 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  28.64 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  27.64 
 
 		 482 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  26.98 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  27.44 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  27.79 
 
 		 536 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  29.19 
 
 		 538 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  27.26 
 
 		 531 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  24.1 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  25.05 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  28.25 
 
 		 474 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  27.79 
 
 		 479 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  26.2 
 
 		 546 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  24.91 
 
 		 533 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.27 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  26.08 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  26.24 
 
 		 532 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  26.07 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  23.91 
 
 		 525 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  28.39 
 
 		 570 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.81 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  23.79 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  25.05 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  24.51 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  26.91 
 
 		 578 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  27.07 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  24.39 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  27.34 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  24.28 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  25.3 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  23.86 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  25 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  23.48 
 
 		 534 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  26.01 
 
 		 476 aa  53.5  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  22.36 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>