79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4224 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1085    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  39.27 
 
 		 526 aa  340  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  39.92 
 
 		 530 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  37.5 
 
 		 543 aa  300  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  33.27 
 
 		 514 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  30.6 
 
 		 552 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  33.21 
 
 		 541 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  33.33 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  31.4 
 
 		 517 aa  200  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  30.71 
 
 		 528 aa  196  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  29.45 
 
 		 532 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  28.84 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  28.88 
 
 		 504 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  27.67 
 
 		 509 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  28.39 
 
 		 525 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  26.93 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  26.03 
 
 		 528 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  26.81 
 
 		 505 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  26.69 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  25.74 
 
 		 489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  28.78 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  26.27 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  26.07 
 
 		 506 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  26.51 
 
 		 540 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  26.07 
 
 		 508 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  25 
 
 		 520 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  24.27 
 
 		 536 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  24.61 
 
 		 529 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  24.6 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  25.65 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  26.02 
 
 		 474 aa  106  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  24.86 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  25.18 
 
 		 508 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  26.63 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  27.65 
 
 		 482 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  28.54 
 
 		 498 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  27.52 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  23.19 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  25.41 
 
 		 533 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  26.19 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  24.64 
 
 		 489 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  26.35 
 
 		 510 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  26.5 
 
 		 488 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  25.44 
 
 		 547 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  25 
 
 		 514 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  24.2 
 
 		 476 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  25.05 
 
 		 482 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  25.39 
 
 		 513 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  24.44 
 
 		 499 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  23.44 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  24.25 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  24.19 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  24.86 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  26.09 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  25 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  26.93 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  24.33 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  23.94 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  37.5 
 
 		 546 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  25.64 
 
 		 534 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  23.86 
 
 		 541 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  23.71 
 
 		 515 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  24.07 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  26.87 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  22.28 
 
 		 570 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  25.27 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  22.16 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  30.05 
 
 		 518 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  22.04 
 
 		 480 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  24.24 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  23.88 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  22.87 
 
 		 536 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  24.19 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  21.79 
 
 		 472 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  26.64 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  20.72 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  21.55 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  23.53 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  20.47 
 
 		 478 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>