80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2344 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  100 
 
 
478 aa  975    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  58.55 
 
 
473 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  44.07 
 
 
474 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  31.98 
 
 
472 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  28.54 
 
 
446 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  27.74 
 
 
463 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.24 
 
 
489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.08 
 
 
487 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  26.42 
 
 
483 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  26.31 
 
 
492 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  26.7 
 
 
508 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  25 
 
 
500 aa  97.8  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  24.28 
 
 
536 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  23.08 
 
 
486 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  25.7 
 
 
510 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  26.1 
 
 
514 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  29.44 
 
 
484 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  26.77 
 
 
481 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  25.69 
 
 
482 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  25.95 
 
 
488 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  25.87 
 
 
474 aa  87.4  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.1 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  24.54 
 
 
525 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  26.1 
 
 
513 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  24.4 
 
 
526 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  24.13 
 
 
547 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  23.99 
 
 
511 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  25.55 
 
 
499 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  24.46 
 
 
522 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  23.87 
 
 
500 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  24.85 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  22.93 
 
 
487 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  24.03 
 
 
532 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  25.35 
 
 
546 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  24.65 
 
 
529 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  25.64 
 
 
476 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  25.64 
 
 
528 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  24.82 
 
 
505 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  22.85 
 
 
504 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  24.21 
 
 
543 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  24.6 
 
 
515 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  24.11 
 
 
525 aa  73.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  23.7 
 
 
506 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  25.24 
 
 
498 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  22.34 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  23.39 
 
 
540 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  25.79 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  24.55 
 
 
479 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  24.3 
 
 
518 aa  70.1  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  23.67 
 
 
508 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  24.41 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  24.41 
 
 
526 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  21.35 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  23.31 
 
 
533 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  24.78 
 
 
578 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  23.93 
 
 
552 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  24.51 
 
 
520 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  23.3 
 
 
479 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  23.26 
 
 
528 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  24.17 
 
 
476 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  25.11 
 
 
570 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  22.22 
 
 
536 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  25.44 
 
 
517 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  24.44 
 
 
531 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  23.61 
 
 
515 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  23.4 
 
 
510 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  24.07 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  24.82 
 
 
532 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  22.24 
 
 
530 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  25 
 
 
524 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  21.41 
 
 
498 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  23.76 
 
 
492 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  23.41 
 
 
534 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  21.56 
 
 
533 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  23.78 
 
 
532 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  26.5 
 
 
504 aa  46.6  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  23.91 
 
 
488 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  23.44 
 
 
476 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  23.54 
 
 
534 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  20.47 
 
 
525 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>