123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3976 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3976  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  430  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.417481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3883  hypothetical protein  98.63 
 
 		 219 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  98.63 
 
 		 219 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4689  hypothetical protein  91.32 
 
 		 219 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  89.5 
 
 		 221 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  89.5 
 
 		 221 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  89.5 
 
 		 221 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0113  hypothetical protein  69.41 
 
 		 225 aa  299  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0467545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4105  SNARE associated Golgi protein  55.76 
 
 		 221 aa  247  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0283  hypothetical protein  49.21 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.3415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0073  hypothetical protein  85.85 
 
 		 106 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0758  SNARE associated Golgi protein  40.28 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.826687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  36.07 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00383  hypothetical protein  35.71 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  35.11 
 
 		 239 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  35.05 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0135  hypothetical protein  39.13 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1535  hypothetical protein  40.53 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2048  SNARE associated Golgi protein  35.76 
 
 		 243 aa  95.9  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0975  hypothetical protein  38 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03390  hypothetical protein  32.26 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1112  hypothetical protein  33.13 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  27.27 
 
 		 714 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  41.07 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  35.4 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  24.44 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  31.13 
 
 		 714 aa  62  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  23.87 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  22.48 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  25.78 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.6 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  27.01 
 
 		 738 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  29.85 
 
 		 717 aa  58.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  29.31 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  31.97 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.89 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  29.07 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  29.25 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  34.09 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  26.54 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.85 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  30.63 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  31.25 
 
 		 714 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  27.89 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  25.61 
 
 		 735 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  27.81 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  32.21 
 
 		 722 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  28.48 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  30.25 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  29.63 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.89 
 
 		 722 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.67 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  30.6 
 
 		 716 aa  52  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  30.84 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  30.5 
 
 		 738 aa  52  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.98 
 
 		 713 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  29.03 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  21.6 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.88 
 
 		 722 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  30.71 
 
 		 716 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  27.71 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  26.53 
 
 		 735 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.84 
 
 		 701 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  24.83 
 
 		 732 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  26.32 
 
 		 720 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  24.83 
 
 		 732 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  30.97 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.29 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.25 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  28.26 
 
 		 623 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  30.06 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  27.34 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  24.83 
 
 		 732 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  25.39 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  28.87 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  28.41 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  27.61 
 
 		 282 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  27.61 
 
 		 282 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  23.39 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  29.25 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  25 
 
 		 704 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.88 
 
 		 717 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  30.85 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  27.74 
 
 		 803 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  26.72 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  27.61 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  28.3 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  24.5 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  28.45 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  28.67 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  26.09 
 
 		 739 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  25.68 
 
 		 240 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  31.03 
 
 		 259 aa  45.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 		 739 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.1 
 
 		 717 aa  45.1  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>