218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1042 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  57.08 
 
 		 231 aa  268  8e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  59.36 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  54.95 
 
 		 717 aa  242  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  54.71 
 
 		 738 aa  238  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.35 
 
 		 713 aa  228  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  58.17 
 
 		 716 aa  228  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.7 
 
 		 717 aa  228  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.66 
 
 		 722 aa  224  9e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.67 
 
 		 722 aa  222  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  51.98 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  53.36 
 
 		 722 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.54 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  50.24 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  46.54 
 
 		 238 aa  205  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  47.32 
 
 		 716 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.49 
 
 		 717 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50 
 
 		 712 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  44.02 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  48.1 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  46.43 
 
 		 704 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  50.48 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  50.25 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  51.82 
 
 		 720 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  47.17 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  47.17 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  49.24 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  42.61 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.81 
 
 		 746 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.86 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  44.44 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  43.33 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  46.19 
 
 		 713 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.39 
 
 		 705 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 		 246 aa  118  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  38.1 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  35.64 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  30.34 
 
 		 714 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  35.42 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  42.57 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  32.14 
 
 		 714 aa  96.3  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  34.76 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  44.19 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  37.04 
 
 		 320 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  31.98 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1788  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 		 314 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249086 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  34.67 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  38.57 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  37.16 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  33.16 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.39 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  34.76 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  37.12 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  35.19 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  32.97 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  42.61 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  39.85 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  35.61 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  39.37 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  32.18 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  36.5 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  34.05 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  31.95 
 
 		 732 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  32.43 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  31.36 
 
 		 732 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  31.36 
 
 		 732 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  31.94 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  29.61 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  29.89 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  32.84 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  35.46 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  28.8 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  31.78 
 
 		 746 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.34 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  31.86 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  30.34 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  36.11 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  28.76 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  29.95 
 
 		 267 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  28.76 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  28.76 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  28.76 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  27.75 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0460  hypothetical protein  29.89 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.955509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  37.39 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  31.45 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  30.67 
 
 		 728 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  30.67 
 
 		 728 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  34.44 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  28.76 
 
 		 739 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  28.76 
 
 		 739 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  30.85 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  34.62 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  30.1 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  34.62 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  34.62 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  28.57 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  28.66 
 
 		 724 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  29.44 
 
 		 623 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  33.1 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>