171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1058 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  97.06 
 
 		 238 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  85.84 
 
 		 219 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  54.55 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  58.4 
 
 		 243 aa  225  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  53.36 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  41.48 
 
 		 714 aa  175  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  41.43 
 
 		 714 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  46.88 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  45.27 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  33.18 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  38.38 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  32.89 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  36.44 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  37.31 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  32.23 
 
 		 224 aa  98.6  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  33.62 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  34.48 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  36.45 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  34.29 
 
 		 224 aa  95.5  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  34.13 
 
 		 252 aa  95.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.11 
 
 		 228 aa  95.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  31.53 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  34.54 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  36.46 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 		 722 aa  92  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  36.82 
 
 		 265 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.68 
 
 		 746 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  35.91 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  34.57 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  33.51 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  33 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  33.76 
 
 		 320 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 		 722 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.86 
 
 		 713 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.95 
 
 		 722 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  31.72 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  33.71 
 
 		 704 aa  82  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  30.96 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  38.97 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  34.78 
 
 		 717 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.34 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  37.38 
 
 		 720 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  30.43 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  37.24 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.55 
 
 		 717 aa  79  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  34.48 
 
 		 738 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  35.23 
 
 		 716 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  34.68 
 
 		 716 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  30.46 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.09 
 
 		 717 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  43.7 
 
 		 325 aa  75.1  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6067  SNARE associated Golgi protein  37.56 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  32.87 
 
 		 713 aa  72.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.16 
 
 		 705 aa  72.4  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.89 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  28.5 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  36.36 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  35.56 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.46 
 
 		 712 aa  65.1  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.12 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  30.05 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  31.9 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.72 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0460  hypothetical protein  29.5 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.955509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  31.85 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  28.06 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  34.29 
 
 		 623 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  35.14 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  30.34 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  29.73 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  27.91 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  33.08 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  26.54 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  27.91 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  32.9 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  26.54 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  29.5 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  27.39 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  30.52 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  32 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  34.31 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  34.31 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  34.31 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  30.58 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  32.26 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  30.99 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  32.19 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  21.51 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  25.3 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  30.65 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  29.93 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  34.92 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  31.55 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  27.41 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  27.41 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>