250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3750 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  471  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  69.23 
 
 		 224 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  67.26 
 
 		 224 aa  298  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  66.82 
 
 		 224 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  64.89 
 
 		 226 aa  294  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  64.32 
 
 		 228 aa  292  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  44.02 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  47.3 
 
 		 717 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  47.16 
 
 		 738 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  47.64 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  46.45 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.1 
 
 		 717 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.98 
 
 		 713 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.48 
 
 		 717 aa  184  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  48.72 
 
 		 716 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  44.1 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.14 
 
 		 722 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.62 
 
 		 722 aa  178  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  46.86 
 
 		 716 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.54 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  43.96 
 
 		 722 aa  171  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  42.23 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  42.79 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  42.45 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  42.29 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.76 
 
 		 746 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  45.71 
 
 		 720 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  40.29 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.67 
 
 		 712 aa  151  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  36.56 
 
 		 704 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.63 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.12 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  39.81 
 
 		 713 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  38.16 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  37.56 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  33.62 
 
 		 227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.89 
 
 		 705 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  31.56 
 
 		 714 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  33 
 
 		 245 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  34.47 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  32.09 
 
 		 714 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  45.38 
 
 		 320 aa  111  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  37.74 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  31.28 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  31.17 
 
 		 623 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  38.55 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  35.64 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  32.54 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  32.54 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  31.84 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  30.96 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  42.31 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  32.87 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  30.59 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  32.11 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  31.66 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  36.07 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  34.53 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  32.02 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  31.1 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  31.56 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  37.98 
 
 		 325 aa  90.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  34.91 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  32.93 
 
 		 245 aa  88.6  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  34.46 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  31.71 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  31.71 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  33.78 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  37.13 
 
 		 225 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  33.87 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  35.57 
 
 		 198 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  39.33 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  36.57 
 
 		 200 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  31.52 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  35.88 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  38.67 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  29.69 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  33.56 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  28.95 
 
 		 724 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  30.54 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  30.11 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  30.36 
 
 		 746 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  35.38 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  33.58 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  35.11 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  25.23 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  30.92 
 
 		 732 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  30.92 
 
 		 732 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  32.43 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  37.35 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  37.21 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  37.21 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  33.51 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  42.86 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  31.97 
 
 		 732 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  28.21 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  36.19 
 
 		 714 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>