204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0389 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  49.28 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  35.96 
 
 		 714 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  36.71 
 
 		 714 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  36.45 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  37.83 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  37.02 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  37.84 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  37.3 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  36.5 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  34.98 
 
 		 228 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  35.71 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.41 
 
 		 746 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  35.47 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  37.97 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  33 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  36.06 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  33.66 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  33.67 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  37.14 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  34.16 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  33.18 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 		 722 aa  111  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  35.24 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  35.33 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  32.21 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.76 
 
 		 717 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.7 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  35.16 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  36.99 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  32.86 
 
 		 717 aa  99  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  31.31 
 
 		 738 aa  98.2  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.34 
 
 		 713 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.58 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  34.63 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.57 
 
 		 722 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.75 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  29.15 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.04 
 
 		 722 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.84 
 
 		 705 aa  95.5  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  31.25 
 
 		 716 aa  95.1  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  31.02 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  31.22 
 
 		 716 aa  94.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  31.84 
 
 		 320 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  30.1 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6067  SNARE associated Golgi protein  34.2 
 
 		 278 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  33.33 
 
 		 713 aa  92.8  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  32.1 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  38.36 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.84 
 
 		 717 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  30.94 
 
 		 704 aa  89.4  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  37.42 
 
 		 720 aa  89  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.23 
 
 		 712 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0460  hypothetical protein  32.16 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.955509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  29.92 
 
 		 623 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  32.62 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  28.97 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  35.19 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  30.73 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  29.93 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  27.72 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  28.65 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.08 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  33.77 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  30.41 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.92 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  36.21 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  28.77 
 
 		 738 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  33.61 
 
 		 735 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  28.87 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  28.87 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  34.85 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  28.26 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  28.74 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  36.53 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  32.34 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  24.17 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  29.66 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  33.33 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  31.34 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  28.14 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  26.7 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  25.45 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  31.13 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.39 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  31.13 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  31.13 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  28.48 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  28.06 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  31.39 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  31.13 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  27.7 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.83 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  31.13 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  26.52 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  30.71 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  31.13 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  28.95 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  31.13 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  26.52 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>