203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1981 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  78.67 
 
 		 227 aa  330  8e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  68.61 
 
 		 229 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.78 
 
 		 228 aa  295  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  66.18 
 
 		 713 aa  260  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  62.44 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  54.22 
 
 		 713 aa  227  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  52.02 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  52.94 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  54.15 
 
 		 716 aa  218  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  50.88 
 
 		 738 aa  218  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  59.2 
 
 		 722 aa  218  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  51.79 
 
 		 717 aa  218  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.79 
 
 		 722 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.89 
 
 		 722 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.87 
 
 		 717 aa  211  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  48.88 
 
 		 716 aa  204  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.66 
 
 		 717 aa  201  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  46.22 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.56 
 
 		 746 aa  198  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.79 
 
 		 712 aa  191  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  45.33 
 
 		 704 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  42.53 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  49.54 
 
 		 720 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  51.74 
 
 		 214 aa  184  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  42.29 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.83 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  41.09 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  41.78 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  46.48 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  42.04 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  44.64 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  39.29 
 
 		 224 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.68 
 
 		 705 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  36.24 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 714 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  36.99 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  31.05 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  34.54 
 
 		 714 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  31.4 
 
 		 252 aa  104  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  33.69 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  30.24 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  46.28 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  34.16 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  33.65 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  34.01 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  33.7 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  37.2 
 
 		 250 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  30.89 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  32.92 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  33.72 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  38.28 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  36.03 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1788  SNARE associated Golgi protein  30.36 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.249086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  30.6 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  33.54 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  30.99 
 
 		 623 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  33.09 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  30.54 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  30.54 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  33.09 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  33.75 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  34.71 
 
 		 325 aa  75.5  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  32.17 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  29.63 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  29.76 
 
 		 724 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  37.96 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  32.23 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  29.63 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  36.11 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  29.55 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  33.61 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  27.43 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  39.8 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.13 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  31.13 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.59 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  36.43 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 		 746 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  29.87 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  30.61 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  29.3 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  35.37 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  29.8 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  29.3 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  23.36 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  29.48 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  28.41 
 
 		 732 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  28.41 
 
 		 732 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  29.14 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  28.41 
 
 		 732 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  29.8 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  29.8 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  29.8 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  29.88 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>