179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2719 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  100 
 
 		 238 aa  453  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  97.06 
 
 		 242 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  84.02 
 
 		 219 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  56.22 
 
 		 244 aa  258  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  58.4 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  54.11 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  41.48 
 
 		 714 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  41.43 
 
 		 714 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  45.09 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  42.5 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  33.19 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  32.52 
 
 		 224 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  36 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  37.37 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  35.47 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  34.5 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  35.33 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  36.82 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  35.24 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 		 228 aa  95.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  35.11 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  31.03 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  34.54 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  35.47 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  39.41 
 
 		 722 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  32.88 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.26 
 
 		 746 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  34 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  33.15 
 
 		 282 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  32.99 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  32.6 
 
 		 282 aa  89  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.36 
 
 		 722 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  33.76 
 
 		 320 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.54 
 
 		 722 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  36.02 
 
 		 717 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  30.96 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  33.54 
 
 		 704 aa  82  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.76 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  30.3 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  36.32 
 
 		 720 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  38.24 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  32.7 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  31.08 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.34 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.71 
 
 		 717 aa  79  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  35.8 
 
 		 716 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  29.11 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  35.06 
 
 		 716 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  34.48 
 
 		 738 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  34.02 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.84 
 
 		 705 aa  76.3  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.22 
 
 		 717 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  42.96 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  32.87 
 
 		 713 aa  72.4  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  35.97 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6067  SNARE associated Golgi protein  33.68 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  36.36 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  28.49 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.89 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  28.71 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0460  hypothetical protein  30.5 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.955509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.14 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.73 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  28.49 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  28.49 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.83 
 
 		 712 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  31.9 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  30.46 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  31.21 
 
 		 623 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  35.77 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  31.72 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  35.77 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  35.77 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  27.15 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  33.85 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  27.16 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  27.16 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  30.72 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  30.83 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  35.04 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  29.52 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  25.9 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  33.56 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  33.74 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  27.39 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  21.51 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  30.21 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  32.88 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  34.92 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  35.04 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  32.88 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  27.21 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.29 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  27.21 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  32.92 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>