203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0273 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  410  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  34.8 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  34.8 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.8 
 
 
705 aa  82.4  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  29.86 
 
 
236 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  29.86 
 
 
236 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  29.86 
 
 
236 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  29.78 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  29.86 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  30.81 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  29.17 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  22.11 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  27.06 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  28.91 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.91 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  28.91 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.56 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  30.92 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  32.14 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  30.99 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.79 
 
 
717 aa  69.3  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.43 
 
 
717 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.59 
 
 
746 aa  68.2  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  28.08 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.9 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  25.26 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.31 
 
 
716 aa  65.5  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  27.39 
 
 
250 aa  64.7  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  27.55 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  25 
 
 
738 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  23.86 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  21.79 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.9 
 
 
713 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  25.85 
 
 
722 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  25.57 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  26.67 
 
 
308 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  27.04 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  27.04 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  26.86 
 
 
229 aa  62.4  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  25.87 
 
 
803 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  27.74 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  25.64 
 
 
717 aa  62.4  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  26.35 
 
 
149 aa  61.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  25.77 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  28.95 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  28.09 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  21.89 
 
 
704 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  28.09 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  27.63 
 
 
271 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  24.67 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  27.82 
 
 
724 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  25.5 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  29.05 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  27.03 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  27.85 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  22.86 
 
 
716 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  28.5 
 
 
253 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  27.01 
 
 
304 aa  58.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  21.24 
 
 
238 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.69 
 
 
251 aa  58.5  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  25.41 
 
 
242 aa  58.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  22.92 
 
 
320 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  27.71 
 
 
235 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.71 
 
 
235 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  27.71 
 
 
235 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  27.71 
 
 
235 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  27.71 
 
 
235 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  27.71 
 
 
235 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  27.71 
 
 
235 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  21.98 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  30.51 
 
 
717 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  26.8 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  25.61 
 
 
623 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  27.11 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.58 
 
 
722 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  27.71 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  20.51 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  24.42 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  27.92 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  25.57 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  25.58 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  24 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.68 
 
 
722 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  25.53 
 
 
738 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  23.83 
 
 
264 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  28.93 
 
 
720 aa  55.1  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  27.01 
 
 
720 aa  55.1  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  26.78 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.79 
 
 
713 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  21.79 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  23.08 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  18.79 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  22.22 
 
 
714 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  24.26 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00383  hypothetical protein  24.16 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  30.14 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.41 
 
 
232 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  27.33 
 
 
249 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  26.87 
 
 
258 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>