More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0202 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 803 aa  1583    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  36.23 
 
 		 714 aa  458  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  38.13 
 
 		 717 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  36.5 
 
 		 714 aa  450  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  37.63 
 
 		 735 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.09 
 
 		 701 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  36.88 
 
 		 714 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  37.3 
 
 		 724 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.16 
 
 		 713 aa  365  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  35.13 
 
 		 735 aa  357  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  37.21 
 
 		 728 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  35.69 
 
 		 739 aa  348  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  37.12 
 
 		 728 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  34.37 
 
 		 732 aa  346  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  34.37 
 
 		 732 aa  346  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  33.88 
 
 		 732 aa  343  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  35.42 
 
 		 739 aa  343  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  34.99 
 
 		 746 aa  341  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  37.58 
 
 		 502 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.16 
 
 		 502 aa  301  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  40.36 
 
 		 478 aa  294  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  35.8 
 
 		 491 aa  288  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.24 
 
 		 521 aa  281  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.68 
 
 		 474 aa  278  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  28.52 
 
 		 730 aa  278  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.07 
 
 		 504 aa  275  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  34.33 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  34.92 
 
 		 512 aa  270  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  36.47 
 
 		 518 aa  270  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  36.51 
 
 		 504 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  38.1 
 
 		 482 aa  260  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.85 
 
 		 498 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  27.92 
 
 		 720 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  34.04 
 
 		 525 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  35.49 
 
 		 483 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.45 
 
 		 514 aa  250  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  26.99 
 
 		 738 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.79 
 
 		 503 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  34.74 
 
 		 483 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  34.74 
 
 		 498 aa  243  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  35.03 
 
 		 510 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  34.24 
 
 		 517 aa  228  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  31.61 
 
 		 572 aa  227  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  38.55 
 
 		 515 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.25 
 
 		 517 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.83 
 
 		 513 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.65 
 
 		 507 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.35 
 
 		 507 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  32.85 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  37.36 
 
 		 232 aa  114  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  28.84 
 
 		 533 aa  97.8  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  27.36 
 
 		 470 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  24.26 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  34.97 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  22.56 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  47 
 
 		 239 aa  79.7  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  30.94 
 
 		 236 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  46.53 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  28.93 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  29.94 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  26.2 
 
 		 684 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  29.94 
 
 		 734 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  29.94 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.87 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  30.63 
 
 		 235 aa  75.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  28.53 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  32.14 
 
 		 227 aa  73.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.83 
 
 		 465 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.55 
 
 		 227 aa  72.8  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 246 aa  72.8  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  25.25 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  27.88 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  30.49 
 
 		 242 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  34.43 
 
 		 229 aa  72.4  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  29.5 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  29.05 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2054  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.17 
 
 		 367 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1907  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.17 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  30.6 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  34.81 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  22.75 
 
 		 1783 aa  67.8  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  37.61 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  35.34 
 
 		 320 aa  67.4  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.41 
 
 		 228 aa  67  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 		 228 aa  67  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2087  cardiolipin synthetase domain protein  24.83 
 
 		 394 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.3 
 
 		 632 aa  66.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  21.8 
 
 		 1522 aa  66.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  34.03 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  29.03 
 
 		 149 aa  65.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  25.63 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  25.69 
 
 		 1821 aa  64.7  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  29.06 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  24.6 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1860  cardiolipin synthetase  24.56 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  32.79 
 
 		 252 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  36.13 
 
 		 231 aa  63.9  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  29.05 
 
 		 226 aa  63.9  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>