257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2469 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  97.88 
 
 
236 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  97.88 
 
 
236 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  97.88 
 
 
236 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  97.88 
 
 
236 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  97.03 
 
 
236 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  97.03 
 
 
236 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  97.46 
 
 
236 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  97.92 
 
 
192 aa  371  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  39.52 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  39.13 
 
 
238 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  31.6 
 
 
242 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  40.12 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  36.81 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  37.67 
 
 
239 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  35.42 
 
 
250 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  34.92 
 
 
320 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  39.74 
 
 
222 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  31.84 
 
 
229 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  34.48 
 
 
623 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 
264 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  36.64 
 
 
242 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.16 
 
 
225 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  36.79 
 
 
220 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  38.64 
 
 
231 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  31.07 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  35.39 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  40.65 
 
 
229 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34 
 
 
746 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  35.37 
 
 
220 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  35.4 
 
 
199 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.98 
 
 
716 aa  85.9  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  31.16 
 
 
224 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  31.43 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  30.85 
 
 
206 aa  82  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  33.14 
 
 
227 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  31.87 
 
 
308 aa  81.6  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  32.3 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.33 
 
 
713 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  31.79 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  30.46 
 
 
716 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  30.22 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  34.31 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  29.61 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  35.57 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.93 
 
 
705 aa  79.7  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  31.06 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  31.51 
 
 
258 aa  79  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  32.9 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  32.85 
 
 
149 aa  79  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  33.18 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  31.22 
 
 
267 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  29.69 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  29.69 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  27.27 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  32.19 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  25.7 
 
 
717 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  32.88 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  33.77 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  30.56 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  27.16 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  26.06 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.14 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  30.08 
 
 
717 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  31.54 
 
 
728 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
722 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.35 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  27.59 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  29.71 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  29.1 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.56 
 
 
717 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  31.16 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  30.43 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  33.09 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  29.1 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  32.58 
 
 
714 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  32.58 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  33.09 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.53 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  30.77 
 
 
728 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  30.15 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  30.26 
 
 
713 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  27.88 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  27.92 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  27.92 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.92 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  27.92 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  27.92 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  27.92 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  29.7 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.21 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  27.92 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  30.15 
 
 
738 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.6 
 
 
717 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  29.93 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  29.1 
 
 
732 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  29.1 
 
 
732 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  28.14 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>