271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4229 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  441  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  90.15 
 
 		 240 aa  291  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  48.8 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  43.54 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  45.45 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  42.86 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  44.75 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.26 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  37.09 
 
 		 320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  43.14 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  38.34 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  40.61 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  41.83 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  35.6 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  32.6 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  36.41 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  36.41 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  37.84 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  36.41 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  38.12 
 
 		 735 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  28.8 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5227  hypothetical protein  41.29 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5607  hypothetical protein  41.29 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352858  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  42.95 
 
 		 732 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5315  hypothetical protein  41.29 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  42.31 
 
 		 732 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  42.31 
 
 		 732 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  42.18 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  26.47 
 
 		 217 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  34.53 
 
 		 623 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  42.28 
 
 		 746 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  36.02 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  44.2 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  37.42 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  38.19 
 
 		 735 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  35.26 
 
 		 714 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  38.22 
 
 		 714 aa  96.7  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  34.73 
 
 		 252 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  39.47 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  40.44 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  40.43 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  24.26 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  38.24 
 
 		 224 aa  95.5  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  41.91 
 
 		 739 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  39.72 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  41.91 
 
 		 739 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.95 
 
 		 283 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  43.54 
 
 		 325 aa  93.2  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  39.74 
 
 		 728 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  35.56 
 
 		 717 aa  92.8  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  39.74 
 
 		 728 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.94 
 
 		 247 aa  92  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.91 
 
 		 218 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  36.51 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3450  SNARE associated Golgi protein  36.82 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.98 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.46 
 
 		 701 aa  89.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  32.98 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.97 
 
 		 713 aa  90.1  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  38.19 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  45.52 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  38.61 
 
 		 722 aa  89.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  33.79 
 
 		 220 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  34.08 
 
 		 232 aa  89  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  32.45 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  34.02 
 
 		 724 aa  88.6  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  32.45 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  32.45 
 
 		 236 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  32.45 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3224  hypothetical protein  38.18 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10636  transmembrane protein  38.6 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238726  normal  0.438888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  35.57 
 
 		 714 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  32.45 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  28.93 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  28.93 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  34.42 
 
 		 192 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.13 
 
 		 717 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  31.91 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  36.63 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  34.69 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  44.27 
 
 		 199 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  31.61 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  31.61 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  38.82 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  31.61 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  31.61 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.61 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  38.3 
 
 		 803 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.4 
 
 		 705 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  31.61 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  31.61 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  31.61 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  25.57 
 
 		 738 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.31 
 
 		 746 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>