More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3786 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 		 701 aa  1396    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  42.67 
 
 		 714 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  42.2 
 
 		 735 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  38.71 
 
 		 714 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  38.12 
 
 		 717 aa  481  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  42.57 
 
 		 714 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  37.55 
 
 		 735 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.36 
 
 		 713 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  38.97 
 
 		 746 aa  432  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  36.25 
 
 		 724 aa  432  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  37.99 
 
 		 732 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  38.14 
 
 		 732 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  37.99 
 
 		 732 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  39.24 
 
 		 739 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  39.04 
 
 		 739 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  35.14 
 
 		 803 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  38.15 
 
 		 728 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  38.01 
 
 		 728 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.04 
 
 		 474 aa  365  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  42 
 
 		 491 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  41.81 
 
 		 478 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  41.56 
 
 		 502 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  38.14 
 
 		 512 aa  332  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  41.13 
 
 		 483 aa  330  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  41.58 
 
 		 572 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  41.13 
 
 		 498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.26 
 
 		 502 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  40.09 
 
 		 518 aa  327  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.7 
 
 		 504 aa  327  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  37.96 
 
 		 525 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.14 
 
 		 521 aa  325  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  30.66 
 
 		 720 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  29.1 
 
 		 730 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  41.99 
 
 		 483 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  30.28 
 
 		 738 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.09 
 
 		 498 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  41.16 
 
 		 504 aa  313  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  37.53 
 
 		 504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.87 
 
 		 503 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  40.51 
 
 		 517 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  40.69 
 
 		 482 aa  295  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  39.19 
 
 		 510 aa  292  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.59 
 
 		 514 aa  291  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  41.75 
 
 		 515 aa  236  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.15 
 
 		 507 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.49 
 
 		 513 aa  228  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.16 
 
 		 507 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.84 
 
 		 517 aa  224  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  29.15 
 
 		 470 aa  137  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  32.16 
 
 		 252 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  32.86 
 
 		 232 aa  108  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  29.52 
 
 		 533 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 		 1522 aa  105  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  30.31 
 
 		 533 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  24.95 
 
 		 1821 aa  94.7  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.14 
 
 		 546 aa  93.6  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  24.08 
 
 		 512 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  33.66 
 
 		 236 aa  87.8  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  30.26 
 
 		 226 aa  86.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  25.9 
 
 		 1783 aa  82.8  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  44.64 
 
 		 225 aa  82  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  38.73 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  32.72 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  38.46 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  24.66 
 
 		 759 aa  77.8  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  29.38 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  29.09 
 
 		 228 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  30.87 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  30.87 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  26.46 
 
 		 775 aa  75.1  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  29.6 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  23.67 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  29.33 
 
 		 224 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  27.84 
 
 		 215 aa  72.4  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  31.06 
 
 		 217 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  30.3 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.85 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  23.67 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  32.33 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  23.77 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  31.58 
 
 		 227 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  23.61 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  25.65 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  26.47 
 
 		 833 aa  68.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 		 754 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 		 754 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 		 734 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  32.03 
 
 		 174 aa  68.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.6 
 
 		 526 aa  68.6  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  23.54 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  33.65 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.49 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.31 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.41 
 
 		 717 aa  66.6  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  33.59 
 
 		 266 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  39.05 
 
 		 226 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  22.87 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.02 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  26.44 
 
 		 224 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>