109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5425 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 514 aa  1036    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  76.07 
 
 		 503 aa  797    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  46.72 
 
 		 572 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  46.57 
 
 		 517 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.22 
 
 		 474 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  44.05 
 
 		 478 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  40.82 
 
 		 518 aa  332  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.22 
 
 		 521 aa  312  7.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  39.16 
 
 		 714 aa  299  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.59 
 
 		 701 aa  282  8.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  37.34 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  38.84 
 
 		 714 aa  273  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  35 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.4 
 
 		 502 aa  269  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  37.58 
 
 		 483 aa  266  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  36.33 
 
 		 717 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  35.54 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  37.55 
 
 		 504 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  35.54 
 
 		 498 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  34.66 
 
 		 525 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  34.84 
 
 		 735 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  38.21 
 
 		 732 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  38.21 
 
 		 732 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  39.02 
 
 		 739 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  37.94 
 
 		 732 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.34 
 
 		 498 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.02 
 
 		 504 aa  256  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  38.79 
 
 		 739 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  34.69 
 
 		 724 aa  251  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  34.48 
 
 		 504 aa  249  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  37.45 
 
 		 803 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  34.16 
 
 		 714 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.54 
 
 		 713 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  33.19 
 
 		 512 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  33.56 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  38.37 
 
 		 746 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  37.87 
 
 		 728 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  37.87 
 
 		 728 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  36.66 
 
 		 482 aa  233  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  32.92 
 
 		 735 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  40.05 
 
 		 515 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.81 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.42 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  28.37 
 
 		 730 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  27.78 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  27.1 
 
 		 738 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.94 
 
 		 507 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.54 
 
 		 507 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  28.18 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  27.46 
 
 		 533 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  28.33 
 
 		 512 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  25.42 
 
 		 524 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  24.36 
 
 		 1783 aa  73.9  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.06 
 
 		 632 aa  73.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  23.25 
 
 		 1522 aa  73.9  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  23 
 
 		 759 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  28.03 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.89 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  24.54 
 
 		 1219 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  29.24 
 
 		 734 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  29.24 
 
 		 754 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  29.24 
 
 		 754 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  27.74 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.83 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  22.86 
 
 		 1821 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  31.08 
 
 		 780 aa  57.4  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  21.24 
 
 		 801 aa  57.4  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.54 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  25.35 
 
 		 510 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  23.35 
 
 		 833 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  29.22 
 
 		 818 aa  54.3  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  23.19 
 
 		 497 aa  53.5  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.55 
 
 		 536 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.5 
 
 		 476 aa  53.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  22.52 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  26.79 
 
 		 516 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  26.79 
 
 		 516 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  26.48 
 
 		 655 aa  50.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  20.56 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  29.53 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  20.56 
 
 		 509 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  22.8 
 
 		 775 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 		 684 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  23.75 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  34 
 
 		 668 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  20.3 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  20.3 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  32 
 
 		 1103 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  24.45 
 
 		 537 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.93 
 
 		 382 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.26 
 
 		 474 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  32.98 
 
 		 693 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1664  cardiolipin synthetase domain-containing protein  18.52 
 
 		 405 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0639115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1796  cardiolipin synthetase domain-containing protein  18.52 
 
 		 405 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  29.8 
 
 		 592 aa  47  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.53 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.8 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  32.58 
 
 		 693 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  20.2 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  20.2 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>