134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4847 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  87.28 
 
 		 515 aa  792    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  86.07 
 
 		 513 aa  760    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 517 aa  1019    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  45.34 
 
 		 510 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  42.05 
 
 		 714 aa  324  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.77 
 
 		 502 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  41.14 
 
 		 502 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  40.79 
 
 		 525 aa  316  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  40.04 
 
 		 512 aa  316  8e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.27 
 
 		 504 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.22 
 
 		 474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  41.74 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  41.74 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.5 
 
 		 521 aa  310  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  43.74 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  42.32 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  46.22 
 
 		 478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  40.46 
 
 		 724 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  40.55 
 
 		 735 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  41.75 
 
 		 732 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  44.03 
 
 		 714 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  38.84 
 
 		 518 aa  294  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  40.7 
 
 		 732 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  40.7 
 
 		 732 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  37.61 
 
 		 714 aa  286  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  41.35 
 
 		 739 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  43.5 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  41.35 
 
 		 739 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.43 
 
 		 498 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  38.76 
 
 		 491 aa  279  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.47 
 
 		 701 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  37.3 
 
 		 572 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  40 
 
 		 503 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  37.62 
 
 		 517 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  37.85 
 
 		 504 aa  264  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.98 
 
 		 514 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  43.3 
 
 		 746 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  36.95 
 
 		 717 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  36.38 
 
 		 803 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  38.7 
 
 		 735 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.64 
 
 		 713 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  40.42 
 
 		 728 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  35.06 
 
 		 720 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  40 
 
 		 728 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  33.19 
 
 		 730 aa  227  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  32.56 
 
 		 738 aa  213  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.55 
 
 		 507 aa  186  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.36 
 
 		 507 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  31.75 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.34 
 
 		 632 aa  97.8  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  31.03 
 
 		 533 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.23 
 
 		 546 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  31.35 
 
 		 510 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  28.86 
 
 		 533 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  31 
 
 		 524 aa  90.9  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  30.61 
 
 		 754 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  30.61 
 
 		 754 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  30.61 
 
 		 734 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.11 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  31.45 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  31.45 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  32.39 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  26.76 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  25.86 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.82 
 
 		 544 aa  66.6  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  31.25 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  25.27 
 
 		 1522 aa  64.3  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.9 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.29 
 
 		 536 aa  60.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  24.78 
 
 		 1821 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  25.19 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  25.65 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  22.42 
 
 		 497 aa  55.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.33 
 
 		 420 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  22.38 
 
 		 1783 aa  53.5  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  22.98 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  25.29 
 
 		 592 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  25.63 
 
 		 482 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  25.09 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  23.03 
 
 		 833 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  21.85 
 
 		 532 aa  51.6  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.19 
 
 		 481 aa  50.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  26.95 
 
 		 479 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1410  phospholipase D/transphosphatidylase  26.59 
 
 		 693 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6419  phospholipase D/transphosphatidylase  26.59 
 
 		 693 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0631752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  27.65 
 
 		 467 aa  50.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  23.37 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  23.86 
 
 		 420 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  27.22 
 
 		 818 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  21.54 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  22.96 
 
 		 684 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  24.1 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  32.28 
 
 		 427 aa  47.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  26.15 
 
 		 396 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  26.01 
 
 		 693 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0490  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  22.42 
 
 		 677 aa  47.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  21.54 
 
 		 470 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1926  phospholipase D/transphosphatidylase  26.11 
 
 		 582 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  23.57 
 
 		 420 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  24.22 
 
 		 474 aa  47.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>