More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1155 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 487 aa  980    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  64.75 
 
 		 487 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  64.01 
 
 		 487 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  61.19 
 
 		 486 aa  620  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  60.37 
 
 		 486 aa  617  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  59.96 
 
 		 486 aa  614  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  56.82 
 
 		 482 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  42.41 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  41 
 
 		 474 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  41.58 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.61 
 
 		 464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.95 
 
 		 464 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.08 
 
 		 474 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  39.06 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  39.76 
 
 		 486 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  42.17 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  40.6 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.17 
 
 		 472 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.28 
 
 		 478 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.22 
 
 		 483 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.98 
 
 		 478 aa  310  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.65 
 
 		 477 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  39.11 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.87 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  38.87 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  39.09 
 
 		 479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  37.68 
 
 		 474 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  38.96 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  38.61 
 
 		 476 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  36.08 
 
 		 484 aa  300  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  38.61 
 
 		 476 aa  300  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.74 
 
 		 478 aa  299  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  34.76 
 
 		 500 aa  299  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.36 
 
 		 474 aa  292  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.38 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  38.04 
 
 		 472 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  36.73 
 
 		 481 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.86 
 
 		 374 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.76 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  39.21 
 
 		 478 aa  276  6e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.84 
 
 		 476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  36.73 
 
 		 477 aa  273  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  38.6 
 
 		 467 aa  273  7e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  37.45 
 
 		 467 aa  266  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  34.16 
 
 		 484 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  36.31 
 
 		 474 aa  259  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  30.99 
 
 		 485 aa  250  5e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  30.08 
 
 		 486 aa  241  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  31.57 
 
 		 474 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.25 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.05 
 
 		 462 aa  206  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  32.17 
 
 		 479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.34 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  31.83 
 
 		 483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.12 
 
 		 479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.37 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.46 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  31.11 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  29.54 
 
 		 532 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  30.8 
 
 		 481 aa  193  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  34.4 
 
 		 486 aa  193  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  29.49 
 
 		 479 aa  193  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  31.71 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  30.39 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  29.39 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  28.93 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.54 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.59 
 
 		 483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  31.79 
 
 		 479 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  31.76 
 
 		 491 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.31 
 
 		 486 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  31.67 
 
 		 481 aa  189  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  27.37 
 
 		 476 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  32.12 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  32.12 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  30.33 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  30.33 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  30.33 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  30.33 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  31.33 
 
 		 483 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  30.33 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  30.33 
 
 		 479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  28.54 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.88 
 
 		 514 aa  187  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  27.75 
 
 		 509 aa  187  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  27.54 
 
 		 509 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  30.57 
 
 		 490 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  29.14 
 
 		 479 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  31.35 
 
 		 490 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  27.85 
 
 		 509 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  27.85 
 
 		 509 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  27.85 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.06 
 
 		 509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  31.98 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  31.98 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  27.85 
 
 		 509 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  26.87 
 
 		 476 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>