More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2153 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 486 aa  976    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  51.52 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.96 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  46.25 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.16 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.73 
 
 		 464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.31 
 
 		 478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  46.09 
 
 		 474 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  48.35 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.82 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  47.01 
 
 		 478 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.86 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.52 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.96 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.05 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  43.74 
 
 		 478 aa  364  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  44.33 
 
 		 476 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  44.66 
 
 		 467 aa  362  6e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.42 
 
 		 477 aa  360  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  44.15 
 
 		 478 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  44.49 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  43.91 
 
 		 481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.91 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  44.04 
 
 		 476 aa  357  3.9999999999999996e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.01 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  43.1 
 
 		 489 aa  350  5e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  39.16 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  41.9 
 
 		 479 aa  346  6e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  38.64 
 
 		 484 aa  345  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  42.89 
 
 		 477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  43.01 
 
 		 472 aa  343  5e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  42.58 
 
 		 480 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.88 
 
 		 374 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  41.37 
 
 		 486 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  40.08 
 
 		 484 aa  336  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  39.76 
 
 		 487 aa  336  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  42.7 
 
 		 477 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  39.71 
 
 		 486 aa  334  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  39.51 
 
 		 486 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.14 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  40.37 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.96 
 
 		 487 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.96 
 
 		 487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  41 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  34.98 
 
 		 485 aa  318  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  32.72 
 
 		 486 aa  306  5.0000000000000004e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.94 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.97 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  38.56 
 
 		 474 aa  286  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  30.21 
 
 		 484 aa  216  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  30.82 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.98 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  34.43 
 
 		 479 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  29.52 
 
 		 484 aa  210  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.69 
 
 		 483 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.3 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  34.26 
 
 		 481 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  33.47 
 
 		 475 aa  206  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.37 
 
 		 502 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  32.24 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.94 
 
 		 541 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.35 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  33 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  33 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  28.76 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  33 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  33 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  33 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  33 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  28.76 
 
 		 509 aa  203  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 		 479 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 		 479 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  31.81 
 
 		 482 aa  202  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  28.33 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  31.69 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  28.08 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.33 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.34 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  28.33 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.54 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  28.33 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.33 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  37.28 
 
 		 472 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  33.82 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.9 
 
 		 485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 		 479 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  32.3 
 
 		 483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.54 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  33.89 
 
 		 489 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  27.86 
 
 		 509 aa  199  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  31.67 
 
 		 483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.97 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  32.52 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  32.32 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  29.08 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  31.21 
 
 		 478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  28.42 
 
 		 514 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1097  phospholipase D/transphosphatidylase  27.94 
 
 		 486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  31.69 
 
 		 479 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>