More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1178 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
425 aa  883    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  61.61 
 
 
420 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  60.64 
 
 
420 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  61.5 
 
 
420 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  63.38 
 
 
427 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  62.12 
 
 
419 aa  483  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  45.2 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.24 
 
 
427 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  40.42 
 
 
436 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  36.41 
 
 
477 aa  249  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  37.2 
 
 
480 aa  242  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.33 
 
 
478 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.87 
 
 
374 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.13 
 
 
474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  35.83 
 
 
462 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.15 
 
 
485 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  36.04 
 
 
502 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  35.1 
 
 
396 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  37.94 
 
 
474 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  34.44 
 
 
514 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  33.8 
 
 
502 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2243  cardiolipin synthetase 2  36.24 
 
 
480 aa  226  7e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  33.25 
 
 
458 aa  226  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  34.17 
 
 
514 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
514 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
514 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
514 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
514 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2081  phospholipase D/transphosphatidylase  36.95 
 
 
475 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
514 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
514 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  33.43 
 
 
483 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.52 
 
 
541 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  34.63 
 
 
502 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3721  phospholipase D/transphosphatidylase  35.92 
 
 
439 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
514 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.77 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  33.98 
 
 
514 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.73 
 
 
478 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.77 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  33.16 
 
 
509 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  35.03 
 
 
482 aa  219  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.5 
 
 
464 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  35.26 
 
 
486 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  35.26 
 
 
486 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.78 
 
 
482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
514 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  32.62 
 
 
509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  37.94 
 
 
478 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  34 
 
 
478 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  34.99 
 
 
486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  32.89 
 
 
509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  32.35 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  32.62 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  32.35 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  32.35 
 
 
509 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  32.35 
 
 
509 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.43 
 
 
478 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  32.35 
 
 
509 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  33.86 
 
 
478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  37.43 
 
 
478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.5 
 
 
490 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3078  phospholipase D/transphosphatidylase  34.76 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  32.09 
 
 
509 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.47 
 
 
483 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.44 
 
 
492 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.58 
 
 
483 aa  210  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  33.8 
 
 
479 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  33.8 
 
 
479 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  34.41 
 
 
490 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  33.68 
 
 
476 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.68 
 
 
476 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 
395 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.7 
 
 
489 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.15 
 
 
476 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  31.54 
 
 
486 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  36.06 
 
 
486 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  33.95 
 
 
476 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  31.08 
 
 
505 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  31.08 
 
 
505 aa  206  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  34.59 
 
 
479 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.71 
 
 
477 aa  206  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.42 
 
 
474 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0482  cardiolipin synthetase, putative  34.97 
 
 
396 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  31.3 
 
 
481 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.79 
 
 
484 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 
479 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  32.79 
 
 
485 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  31.3 
 
 
479 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.79 
 
 
472 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  33.16 
 
 
478 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  31.3 
 
 
479 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  32.9 
 
 
472 aa  203  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  33.24 
 
 
484 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  31.78 
 
 
505 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  32.26 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  34.32 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  32.81 
 
 
479 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  33.06 
 
 
481 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  31.56 
 
 
479 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>