More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1275 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  63.84 
 
 		 484 aa  654    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  80.99 
 
 		 484 aa  821    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  82.02 
 
 		 484 aa  831    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  100 
 
 		 484 aa  1003    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  58.14 
 
 		 485 aa  598  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  57.2 
 
 		 490 aa  595  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  56.7 
 
 		 485 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  55.16 
 
 		 532 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  56.4 
 
 		 484 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  53.29 
 
 		 486 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  53.29 
 
 		 486 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  53.29 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  52.88 
 
 		 486 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  52.47 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  52.47 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  52.47 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  52.26 
 
 		 486 aa  538  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  52.47 
 
 		 486 aa  541  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  52.47 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  52.47 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  52.47 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  52.47 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  52.06 
 
 		 486 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  52.06 
 
 		 486 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  51.65 
 
 		 486 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  51.65 
 
 		 486 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  52.06 
 
 		 486 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  51.65 
 
 		 486 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  51.65 
 
 		 486 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  51.65 
 
 		 486 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  51.23 
 
 		 486 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  50.41 
 
 		 486 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  49.69 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  44.09 
 
 		 492 aa  428  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  39.96 
 
 		 492 aa  354  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  37.86 
 
 		 491 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  34.92 
 
 		 547 aa  317  3e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  34.92 
 
 		 555 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  32.57 
 
 		 479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  32.57 
 
 		 479 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  33.88 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  34.18 
 
 		 481 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  33.89 
 
 		 482 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  32.43 
 
 		 478 aa  246  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.46 
 
 		 479 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  33.26 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  31.87 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  31.87 
 
 		 467 aa  236  6e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  32.55 
 
 		 514 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  32.34 
 
 		 514 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.93 
 
 		 491 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  32.34 
 
 		 514 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  32.34 
 
 		 514 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  32.34 
 
 		 514 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  32.34 
 
 		 514 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  32.34 
 
 		 514 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  32.55 
 
 		 514 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  30.75 
 
 		 489 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  32.55 
 
 		 514 aa  232  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  33.04 
 
 		 471 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.73 
 
 		 485 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.77 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  30.64 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  28.45 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  33.05 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  28.04 
 
 		 509 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  29.1 
 
 		 509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  29.1 
 
 		 509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  29.1 
 
 		 509 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.89 
 
 		 509 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  29.1 
 
 		 509 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.98 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  31.8 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  28.66 
 
 		 509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  31.7 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  28.48 
 
 		 509 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  28.25 
 
 		 509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.61 
 
 		 541 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  28.69 
 
 		 483 aa  219  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.82 
 
 		 477 aa  217  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.97 
 
 		 472 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  30.23 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.39 
 
 		 482 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.03 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.22 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  31.05 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  30.36 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.83 
 
 		 508 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.54 
 
 		 526 aa  206  9e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.97 
 
 		 481 aa  206  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.6 
 
 		 492 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  27.08 
 
 		 476 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  30.17 
 
 		 502 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.94 
 
 		 467 aa  203  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  26.87 
 
 		 476 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  29.8 
 
 		 491 aa  203  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  28.77 
 
 		 490 aa  202  8e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  27.99 
 
 		 505 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  27.99 
 
 		 505 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.07 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>