More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1986 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 475 aa  960    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  44.8 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  40.17 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  40.21 
 
 		 479 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  39.92 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  41.49 
 
 		 482 aa  336  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  35.56 
 
 		 492 aa  279  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  34.23 
 
 		 486 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  34.23 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  34.77 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  34.77 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  33.67 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  34.77 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  35.47 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  35.47 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  35.47 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  32.25 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  35.47 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  35.47 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  34.91 
 
 		 486 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.91 
 
 		 486 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  34.91 
 
 		 486 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  34.91 
 
 		 486 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  34.91 
 
 		 486 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  34.91 
 
 		 486 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  34.91 
 
 		 486 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  33.61 
 
 		 486 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  34.7 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  34.7 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  34.47 
 
 		 486 aa  259  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 		 490 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  33.87 
 
 		 532 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 		 485 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  33.19 
 
 		 484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  32.72 
 
 		 484 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 		 484 aa  252  8.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  36.11 
 
 		 467 aa  252  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  32.64 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  36.19 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  32.32 
 
 		 484 aa  249  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  32.64 
 
 		 485 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 		 484 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  35.89 
 
 		 467 aa  249  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  34.73 
 
 		 472 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.87 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.13 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  33.88 
 
 		 492 aa  244  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  30.4 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  30.26 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 		 514 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 		 514 aa  236  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  29.98 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  30.26 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  30.67 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  30.67 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  30.17 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  30.67 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  33.77 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  34.8 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  30.45 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30.4 
 
 		 514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  30.45 
 
 		 509 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.76 
 
 		 481 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.25 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.88 
 
 		 502 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  30.15 
 
 		 509 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.58 
 
 		 509 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.35 
 
 		 514 aa  229  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  33.77 
 
 		 478 aa  229  9e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  27.77 
 
 		 483 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.69 
 
 		 502 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  35.63 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  30.67 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.71 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.33 
 
 		 474 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.63 
 
 		 472 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.73 
 
 		 464 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  33.55 
 
 		 471 aa  223  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  29.75 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.87 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  32.09 
 
 		 478 aa  219  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  29.08 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  32.96 
 
 		 481 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.13 
 
 		 483 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  30.7 
 
 		 470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  31.86 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  31.73 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  29.2 
 
 		 485 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  33.06 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  31.91 
 
 		 495 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  30.31 
 
 		 479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.03 
 
 		 482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.95 
 
 		 481 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.21 
 
 		 541 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  27.67 
 
 		 476 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.7 
 
 		 472 aa  212  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>