More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2710 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  100 
 
 
489 aa  993    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  47.08 
 
 
478 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.34 
 
 
472 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  45.78 
 
 
472 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  43.61 
 
 
467 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  43.4 
 
 
467 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.16 
 
 
481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.89 
 
 
491 aa  299  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.44 
 
 
479 aa  293  7e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  36.73 
 
 
495 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  36.83 
 
 
491 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  35.02 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  34.39 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  34.54 
 
 
479 aa  271  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  34.93 
 
 
471 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  32.94 
 
 
492 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.5 
 
 
467 aa  244  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  34.2 
 
 
491 aa  243  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
486 aa  243  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
486 aa  243  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  32.04 
 
 
486 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.13 
 
 
478 aa  240  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  30.54 
 
 
486 aa  239  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  30.99 
 
 
532 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  29.74 
 
 
486 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  36.19 
 
 
475 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  36.9 
 
 
481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  32.83 
 
 
492 aa  236  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  31.46 
 
 
486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.5 
 
 
502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  30.82 
 
 
484 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  30.75 
 
 
484 aa  233  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  31.01 
 
 
485 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  29.52 
 
 
483 aa  231  3e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  29.68 
 
 
486 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  33.7 
 
 
482 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  30.69 
 
 
484 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  29.12 
 
 
486 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  29.74 
 
 
484 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  29.87 
 
 
486 aa  227  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  29.94 
 
 
486 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  29.94 
 
 
486 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  29.94 
 
 
486 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  29.94 
 
 
486 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  29.94 
 
 
486 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  29.54 
 
 
485 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  29.87 
 
 
502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  29.68 
 
 
486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  29.46 
 
 
486 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.46 
 
 
486 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  29.46 
 
 
486 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  29.46 
 
 
486 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  29.46 
 
 
486 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  29.46 
 
 
486 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  29.46 
 
 
486 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 
547 aa  219  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  29.68 
 
 
486 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.02 
 
 
514 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  29.81 
 
 
514 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  30 
 
 
476 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  28.25 
 
 
509 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30.17 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30.17 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30.17 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30.17 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30.17 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  28.89 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  29.13 
 
 
490 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  29.96 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30.17 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  31.49 
 
 
473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  29.55 
 
 
514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  28.69 
 
 
509 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  29.09 
 
 
509 aa  213  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.19 
 
 
472 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  28.89 
 
 
509 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  28.89 
 
 
509 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  33.86 
 
 
479 aa  213  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  28.07 
 
 
509 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.31 
 
 
474 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  30 
 
 
476 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  32.95 
 
 
484 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  32.55 
 
 
485 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  28.07 
 
 
509 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.63 
 
 
509 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  31.57 
 
 
477 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.63 
 
 
509 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  31.97 
 
 
480 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  29.55 
 
 
514 aa  209  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.43 
 
 
541 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.96 
 
 
464 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  29.88 
 
 
555 aa  208  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  31.55 
 
 
477 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.84 
 
 
492 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  34.07 
 
 
502 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  33.89 
 
 
479 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.66 
 
 
486 aa  206  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0911  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.81 
 
 
485 aa  206  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000528236 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.67 
 
 
479 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>