More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3886 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  100 
 
 
478 aa  964    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  47.08 
 
 
489 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.28 
 
 
472 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  43.52 
 
 
472 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0548  cardiolipin synthase  42.04 
 
 
467 aa  360  3e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0483  phospholipase D/transphosphatidylase  41.83 
 
 
467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.41 
 
 
481 aa  330  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.95 
 
 
491 aa  299  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  38 
 
 
471 aa  293  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  38.38 
 
 
491 aa  286  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  37.5 
 
 
495 aa  282  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  33.06 
 
 
492 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  35.81 
 
 
486 aa  280  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  35.81 
 
 
486 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  35.81 
 
 
486 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.88 
 
 
479 aa  277  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  34.97 
 
 
486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  34.97 
 
 
486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  32.17 
 
 
476 aa  270  5e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  34.53 
 
 
486 aa  269  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  34.37 
 
 
492 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  34.63 
 
 
547 aa  264  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  31.52 
 
 
476 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  34.6 
 
 
490 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  33.92 
 
 
555 aa  261  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  32.84 
 
 
483 aa  260  4e-68  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  33.69 
 
 
486 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  34.06 
 
 
491 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  33.05 
 
 
486 aa  256  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  33.47 
 
 
486 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.47 
 
 
486 aa  256  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  33.47 
 
 
486 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  33.47 
 
 
486 aa  256  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  33.47 
 
 
486 aa  256  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  33.47 
 
 
486 aa  256  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  33.47 
 
 
486 aa  256  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 
486 aa  256  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  33.62 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  33.62 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  33.62 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  33.62 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  33.62 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  33.47 
 
 
486 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  34.37 
 
 
478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  36.38 
 
 
481 aa  252  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  32.41 
 
 
486 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  33.4 
 
 
484 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  33.75 
 
 
532 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  34.19 
 
 
485 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  32.99 
 
 
484 aa  249  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  31.71 
 
 
479 aa  247  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  32.29 
 
 
479 aa  247  4e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  32.43 
 
 
484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  33.05 
 
 
484 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  33.26 
 
 
484 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  32.69 
 
 
485 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  34.62 
 
 
482 aa  237  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  34.31 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.26 
 
 
541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  33.11 
 
 
481 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  33.11 
 
 
479 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  32.68 
 
 
479 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
479 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.78 
 
 
485 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.99 
 
 
478 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.36 
 
 
482 aa  229  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  34.72 
 
 
479 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.46 
 
 
467 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  34.21 
 
 
479 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  34.57 
 
 
479 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  31.86 
 
 
485 aa  226  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.44 
 
 
472 aa  226  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  29.18 
 
 
483 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  34.42 
 
 
479 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  34.2 
 
 
481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.43 
 
 
481 aa  223  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  31.91 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  29.65 
 
 
509 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.67 
 
 
483 aa  222  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  32.12 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0885  cardiolipin synthetase  29.64 
 
 
490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0361948  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  33.77 
 
 
475 aa  220  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  32.14 
 
 
477 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  28.45 
 
 
509 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  29.52 
 
 
509 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.34 
 
 
477 aa  219  7.999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.89 
 
 
374 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  28.66 
 
 
509 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  28.66 
 
 
509 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  28.87 
 
 
509 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1406  phospholipase D/transphosphatidylase  30.64 
 
 
505 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.318723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.62 
 
 
474 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1379  phospholipase D/transphosphatidylase  30.64 
 
 
505 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  28.45 
 
 
509 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  31.24 
 
 
502 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  28.45 
 
 
509 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  28.45 
 
 
509 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  29.23 
 
 
509 aa  216  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.38 
 
 
486 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  30.65 
 
 
499 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>